More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1579 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 
391 aa  794    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.4 
 
 
391 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.66 
 
 
387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.37 
 
 
387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.04 
 
 
387 aa  579  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.11 
 
 
387 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.58 
 
 
387 aa  577  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.58 
 
 
387 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.58 
 
 
387 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.58 
 
 
387 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.11 
 
 
387 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.58 
 
 
387 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.85 
 
 
387 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.85 
 
 
387 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.58 
 
 
387 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.32 
 
 
387 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.77 
 
 
387 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.29 
 
 
391 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.29 
 
 
391 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.99 
 
 
387 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.29 
 
 
391 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.8 
 
 
391 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.29 
 
 
391 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.29 
 
 
391 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.8 
 
 
391 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.54 
 
 
391 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.77 
 
 
391 aa  564  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.29 
 
 
391 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.89 
 
 
390 aa  558  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.79 
 
 
387 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.67 
 
 
390 aa  561  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.64 
 
 
390 aa  554  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.87 
 
 
387 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.97 
 
 
387 aa  542  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.75 
 
 
391 aa  541  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.13 
 
 
386 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.27 
 
 
387 aa  539  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2392  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.77 
 
 
392 aa  534  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.94 
 
 
386 aa  528  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.17 
 
 
374 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.03 
 
 
387 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.03 
 
 
387 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.96 
 
 
391 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.03 
 
 
387 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.69 
 
 
391 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.54 
 
 
387 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.03 
 
 
387 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.54 
 
 
387 aa  525  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.15 
 
 
387 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.62 
 
 
387 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0475823 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  65.54 
 
 
387 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  65.54 
 
 
387 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.15 
 
 
387 aa  524  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.89 
 
 
387 aa  524  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.89 
 
 
387 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.84 
 
 
387 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  65.62 
 
 
387 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.51 
 
 
387 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.58 
 
 
387 aa  518  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.68 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.68 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.68 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.6 
 
 
387 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.19 
 
 
387 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
390 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
390 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  47.28 
 
 
398 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  47.89 
 
 
403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  48.14 
 
 
401 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.78 
 
 
398 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  46.91 
 
 
399 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.77 
 
 
402 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  48.15 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  46.56 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  46.82 
 
 
394 aa  332  8e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.79 
 
 
401 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.41 
 
 
391 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  48.2 
 
 
382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.78 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  48.18 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  47.37 
 
 
391 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.53 
 
 
404 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 
392 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  47.77 
 
 
391 aa  322  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
388 aa  322  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  44.96 
 
 
382 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.71 
 
 
380 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  45.95 
 
 
378 aa  319  5e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 
390 aa  319  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  47.94 
 
 
378 aa  319  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.16 
 
 
401 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 
390 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.69 
 
 
400 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 
390 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 
390 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 
390 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 
390 aa  316  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 
390 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 
390 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 
390 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>