More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0639  acetyl-CoA acetyltransferase  79.56 
 
 
405 aa  658    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
406 aa  825    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  76.11 
 
 
405 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8569  Acetyl-CoA C-acyltransferase  77.83 
 
 
406 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  80.3 
 
 
406 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  81.28 
 
 
406 aa  681    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  82.76 
 
 
406 aa  685    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  77.09 
 
 
406 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  82.76 
 
 
406 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0436  acetyl-CoA acetyltransferase  80.1 
 
 
407 aa  634  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  75.37 
 
 
405 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  75.37 
 
 
405 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  76.35 
 
 
405 aa  628  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  75.6 
 
 
414 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1371  acetyl-CoA acetyltransferase  74.81 
 
 
404 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0816349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  74.38 
 
 
405 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  73.4 
 
 
405 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  76.17 
 
 
406 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0851  acetyl-CoA acetyltransferase  73.61 
 
 
420 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0908  acetyl-CoA acetyltransferase  72.4 
 
 
420 aa  611  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  73.65 
 
 
406 aa  599  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4616  acetyl-CoA acetyltransferase  75.36 
 
 
412 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  76.11 
 
 
406 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  70.1 
 
 
407 aa  567  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1615  acetyl-CoA acetyltransferase  68.55 
 
 
415 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.690139  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  65.6 
 
 
405 aa  534  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 
412 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2347  acetyl-CoA acetyltransferase  62.38 
 
 
404 aa  487  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000971024  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  52.59 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  51.07 
 
 
396 aa  398  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  43.92 
 
 
391 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 
391 aa  322  8e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  44.14 
 
 
395 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 
398 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.49 
 
 
391 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  41.97 
 
 
390 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  41.83 
 
 
392 aa  315  7e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  42.17 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  43.07 
 
 
378 aa  312  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  43.8 
 
 
399 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
398 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  42.33 
 
 
377 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.41 
 
 
400 aa  310  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  41.89 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  39.47 
 
 
393 aa  307  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  43.84 
 
 
378 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  39.09 
 
 
391 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  40.19 
 
 
392 aa  306  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.75 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  39.52 
 
 
392 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  42.25 
 
 
379 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  41.11 
 
 
390 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  42.26 
 
 
378 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  42.29 
 
 
392 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  42.57 
 
 
385 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  41.35 
 
 
390 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  41.3 
 
 
388 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
390 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  40.49 
 
 
384 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  41.77 
 
 
390 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  41.29 
 
 
390 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  41.51 
 
 
401 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  41.16 
 
 
400 aa  298  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.62 
 
 
390 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.93 
 
 
387 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  41.53 
 
 
390 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
390 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
390 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
390 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  41.05 
 
 
392 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
390 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
390 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
390 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  42.33 
 
 
378 aa  295  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  41.73 
 
 
380 aa  295  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  40.57 
 
 
390 aa  295  7e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.59 
 
 
387 aa  295  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.05 
 
 
391 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  41.49 
 
 
398 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.59 
 
 
387 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  40.98 
 
 
382 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.59 
 
 
387 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.83 
 
 
387 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.93 
 
 
387 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 
403 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  41.25 
 
 
399 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 
389 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.35 
 
 
387 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  39.57 
 
 
392 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  38.7 
 
 
392 aa  292  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  42.26 
 
 
394 aa  292  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  43.09 
 
 
414 aa  292  9e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  42.72 
 
 
392 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  41.36 
 
 
409 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  42.72 
 
 
392 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  40.48 
 
 
396 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  40.38 
 
 
390 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  39.62 
 
 
398 aa  290  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.83 
 
 
387 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.11 
 
 
400 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>