More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1743 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 378 aa  745    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  74.27 
 
 		 378 aa  581  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  69.84 
 
 		 378 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  71.32 
 
 		 380 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  68.85 
 
 		 382 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  62.23 
 
 		 379 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  67.46 
 
 		 378 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  61.01 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  60.52 
 
 		 385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  60.53 
 
 		 377 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  59.26 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  47.68 
 
 		 390 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  47.44 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  46.41 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 		 392 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 391 aa  332  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  49.34 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 		 390 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 391 aa  329  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.23 
 
 		 387 aa  329  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 		 390 aa  329  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 		 390 aa  329  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 		 390 aa  328  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.84 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  47.41 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.74 
 
 		 387 aa  325  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.49 
 
 		 387 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.97 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.74 
 
 		 387 aa  322  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  47.12 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  47.68 
 
 		 390 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  48.87 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  47.16 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  47.58 
 
 		 392 aa  319  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  46.83 
 
 		 392 aa  319  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 406 aa  318  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.36 
 
 		 387 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.36 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.75 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.42 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.47 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.36 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.36 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  48.31 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.36 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  46.34 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.76 
 
 		 401 aa  316  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.98 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  48.36 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  46.11 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.97 
 
 		 387 aa  316  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.76 
 
 		 401 aa  316  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.04 
 
 		 391 aa  315  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.85 
 
 		 387 aa  315  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  47.34 
 
 		 399 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.76 
 
 		 401 aa  315  8e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.76 
 
 		 401 aa  315  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.1 
 
 		 387 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4036  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 		 399 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  45.14 
 
 		 398 aa  314  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2637  acetyl-CoA acetyltransferase  46.84 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.357851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2771  acetyl-CoA acetyltransferase  46.84 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 401 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 401 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.88 
 
 		 414 aa  312  4.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 		 406 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  47.44 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.87 
 
 		 386 aa  310  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2107  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 		 399 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0857857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2719  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 		 399 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 		 399 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0055718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.25 
 
 		 391 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>