More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3795 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 378 aa  753    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  69.5 
 
 		 378 aa  541  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  69.84 
 
 		 378 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  71.73 
 
 		 382 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  68.95 
 
 		 380 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  71.69 
 
 		 378 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  67.27 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  66.31 
 
 		 377 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  64.36 
 
 		 379 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 378 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  57.29 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  51.29 
 
 		 388 aa  358  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  51.59 
 
 		 391 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 		 392 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  51.19 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  48.01 
 
 		 398 aa  342  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  47.88 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  48.26 
 
 		 398 aa  339  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  49.35 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.07 
 
 		 391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  48.71 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.45 
 
 		 390 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  49.07 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  47.38 
 
 		 384 aa  332  9e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.7 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.96 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.76 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.93 
 
 		 387 aa  325  6e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 		 390 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.97 
 
 		 387 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  46.81 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.45 
 
 		 387 aa  322  8e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.48 
 
 		 424 aa  322  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  48.83 
 
 		 402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  46.84 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  46.54 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  46.54 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  47.33 
 
 		 398 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.68 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  45.27 
 
 		 392 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.03 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.13 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.23 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.41 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  46.56 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  46.33 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.37 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.2 
 
 		 387 aa  316  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  46.3 
 
 		 392 aa  316  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.2 
 
 		 387 aa  315  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 		 398 aa  316  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 		 405 aa  315  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.2 
 
 		 387 aa  315  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.2 
 
 		 387 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  44.8 
 
 		 406 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1550  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000109593  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 		 394 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 		 394 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.56 
 
 		 387 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  46.13 
 
 		 401 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.2 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.13 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  45.06 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.94 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  47.64 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  44.8 
 
 		 395 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  44.99 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  45.24 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  45.24 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  45.24 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  45.24 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  45.24 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  47.94 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  45.24 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  44.88 
 
 		 412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  48.39 
 
 		 389 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.05 
 
 		 390 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.68 
 
 		 391 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.99 
 
 		 391 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  45.33 
 
 		 392 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.94 
 
 		 387 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>