More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1160 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
412 aa  827    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  68.93 
 
 
407 aa  578  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  66.1 
 
 
406 aa  541  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  66.59 
 
 
406 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  65.29 
 
 
405 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  65.53 
 
 
405 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  65.13 
 
 
406 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  63.83 
 
 
405 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  63.83 
 
 
405 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  63.83 
 
 
405 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0639  acetyl-CoA acetyltransferase  64.56 
 
 
405 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  63.59 
 
 
405 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  65.94 
 
 
406 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  64.07 
 
 
414 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  65.13 
 
 
406 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0851  acetyl-CoA acetyltransferase  64.83 
 
 
420 aa  524  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8569  Acetyl-CoA C-acyltransferase  64.41 
 
 
406 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0908  acetyl-CoA acetyltransferase  64.35 
 
 
420 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  65.78 
 
 
405 aa  519  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  64.58 
 
 
406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0436  acetyl-CoA acetyltransferase  66.18 
 
 
407 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  64.65 
 
 
406 aa  511  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1371  acetyl-CoA acetyltransferase  63.26 
 
 
404 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0816349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4616  acetyl-CoA acetyltransferase  64.83 
 
 
412 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 
406 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1615  acetyl-CoA acetyltransferase  60.77 
 
 
415 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.690139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 
406 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2347  acetyl-CoA acetyltransferase  59.28 
 
 
404 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000971024  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
390 aa  398  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  50.82 
 
 
396 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.61 
 
 
400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.58 
 
 
399 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 
398 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 
398 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  45.61 
 
 
391 aa  329  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  46.44 
 
 
395 aa  327  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  44.76 
 
 
398 aa  325  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
392 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  44.74 
 
 
391 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 
378 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.55 
 
 
391 aa  322  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.94 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.63 
 
 
402 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.94 
 
 
402 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.13 
 
 
402 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  44.88 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  42.38 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.05 
 
 
401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  43.88 
 
 
401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  42.96 
 
 
396 aa  313  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 
378 aa  312  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.29 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 
403 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  40.57 
 
 
393 aa  312  9e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  46.86 
 
 
385 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  44.1 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  45.26 
 
 
390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  44.79 
 
 
390 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  43.66 
 
 
377 aa  309  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  44.66 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.53 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  42.92 
 
 
390 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.79 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  42.92 
 
 
390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  41.35 
 
 
384 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.55 
 
 
406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  40.62 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.11 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  44.88 
 
 
379 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  41.94 
 
 
394 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  41.47 
 
 
390 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  40.52 
 
 
398 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  44.37 
 
 
393 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.44 
 
 
402 aa  299  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  40.75 
 
 
399 aa  299  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  40.66 
 
 
392 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.39 
 
 
401 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  44.16 
 
 
411 aa  298  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.55 
 
 
399 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  41.44 
 
 
399 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  46.39 
 
 
404 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  41.69 
 
 
399 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  43.26 
 
 
402 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  40.85 
 
 
400 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  40.09 
 
 
392 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  40.71 
 
 
399 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  41.45 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  42.79 
 
 
399 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  41.45 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  41.45 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  42.28 
 
 
392 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  41.22 
 
 
399 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  41.45 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  41.45 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  41.45 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  41.45 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  43.58 
 
 
409 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
390 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.12 
 
 
401 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>