More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0436 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  77.15 
 
 		 406 aa  634    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  84.52 
 
 		 406 aa  686    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0436  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 407 aa  823    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  76.66 
 
 		 406 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  80.1 
 
 		 406 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  85.75 
 
 		 406 aa  717    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  80.1 
 
 		 406 aa  658    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8569  Acetyl-CoA C-acyltransferase  82.06 
 
 		 406 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  77.4 
 
 		 406 aa  641    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0639  acetyl-CoA acetyltransferase  76.41 
 
 		 405 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1371  acetyl-CoA acetyltransferase  76.11 
 
 		 404 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0816349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  80.1 
 
 		 406 aa  617  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  74.2 
 
 		 405 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  75.68 
 
 		 405 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  73.71 
 
 		 405 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  73.71 
 
 		 405 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  72.73 
 
 		 405 aa  608  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  72.73 
 
 		 405 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  72.05 
 
 		 414 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0908  acetyl-CoA acetyltransferase  70.29 
 
 		 420 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0851  acetyl-CoA acetyltransferase  70.77 
 
 		 420 aa  594  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4616  acetyl-CoA acetyltransferase  75.42 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  71.25 
 
 		 406 aa  581  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  70.66 
 
 		 407 aa  580  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1615  acetyl-CoA acetyltransferase  70.1 
 
 		 415 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.690139  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  68.38 
 
 		 405 aa  548  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  65.46 
 
 		 412 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2347  acetyl-CoA acetyltransferase  63.46 
 
 		 404 aa  488  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000971024  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  55.06 
 
 		 390 aa  421  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  52 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.3 
 
 		 398 aa  319  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  43.53 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.11 
 
 		 391 aa  315  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  44.93 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  41.29 
 
 		 392 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.44 
 
 		 401 aa  311  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  43.68 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.79 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  43.33 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  43.95 
 
 		 378 aa  306  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  43.03 
 
 		 400 aa  306  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  41.63 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 		 398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  41.83 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  44.15 
 
 		 399 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  42.96 
 
 		 377 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  42.69 
 
 		 401 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  43.41 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  43.84 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.65 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.51 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.75 
 
 		 391 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  42.28 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  42.69 
 
 		 390 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  41.15 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  42.45 
 
 		 394 aa  299  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  44.66 
 
 		 392 aa  298  8e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.13 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  40.63 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  41.95 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  43.13 
 
 		 403 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.55 
 
 		 387 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  39.14 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.27 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.27 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.79 
 
 		 387 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.21 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.27 
 
 		 387 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.27 
 
 		 387 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  39.38 
 
 		 393 aa  295  9e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.4 
 
 		 387 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.79 
 
 		 387 aa  295  9e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  40.71 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.03 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.03 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  41.05 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.3 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  44.31 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.3 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.06 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3590  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  42.28 
 
 		 399 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  41.05 
 
 		 390 aa  292  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 		 398 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  42.47 
 
 		 378 aa  292  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  41.05 
 
 		 390 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  40.67 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.06 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.4 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  41.23 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>