More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5284 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  98.71 
 
 
387 aa  780    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  98.97 
 
 
387 aa  782    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  95.09 
 
 
387 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  83.72 
 
 
387 aa  688    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  99.22 
 
 
387 aa  785    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  94.06 
 
 
387 aa  752    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  99.48 
 
 
387 aa  786    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  98.97 
 
 
387 aa  783    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  85.01 
 
 
387 aa  687    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  97.93 
 
 
387 aa  775    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  80.62 
 
 
387 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  98.71 
 
 
387 aa  781    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  80.62 
 
 
387 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  94.83 
 
 
387 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  92.51 
 
 
387 aa  746    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  94.83 
 
 
387 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  81.14 
 
 
387 aa  665    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.59 
 
 
387 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.5 
 
 
387 aa  688    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  95.09 
 
 
387 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 
387 aa  791    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  80.62 
 
 
387 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  98.71 
 
 
387 aa  780    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.3 
 
 
391 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.68 
 
 
387 aa  599  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.61 
 
 
387 aa  598  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.9 
 
 
387 aa  596  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.58 
 
 
387 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.39 
 
 
387 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.64 
 
 
387 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.06 
 
 
387 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.13 
 
 
387 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 
387 aa  588  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.06 
 
 
387 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.13 
 
 
387 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.13 
 
 
387 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.13 
 
 
387 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.8 
 
 
387 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.13 
 
 
387 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.61 
 
 
387 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.87 
 
 
387 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.39 
 
 
387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.14 
 
 
374 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.22 
 
 
387 aa  559  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.7 
 
 
386 aa  552  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.22 
 
 
386 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.84 
 
 
391 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.84 
 
 
391 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.84 
 
 
391 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.84 
 
 
391 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.84 
 
 
391 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.43 
 
 
391 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.8 
 
 
391 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.51 
 
 
390 aa  509  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.8 
 
 
391 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.8 
 
 
391 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.8 
 
 
391 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.45 
 
 
391 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.15 
 
 
391 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.95 
 
 
390 aa  495  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.69 
 
 
390 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.94 
 
 
391 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.76 
 
 
391 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2392  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.5 
 
 
392 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 
390 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 
402 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 
390 aa  345  7e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  48.13 
 
 
403 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.9 
 
 
402 aa  338  8e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.57 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.32 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  46.4 
 
 
401 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  47.85 
 
 
394 aa  333  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  46.7 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  46.95 
 
 
390 aa  328  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  46.7 
 
 
390 aa  328  9e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  47.9 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  46.7 
 
 
390 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  46.7 
 
 
390 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  46.7 
 
 
390 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  46.7 
 
 
390 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  46.45 
 
 
390 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.54 
 
 
412 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  46.45 
 
 
390 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  46.45 
 
 
390 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  45.68 
 
 
400 aa  322  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 
390 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.43 
 
 
401 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.43 
 
 
401 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.43 
 
 
401 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.96 
 
 
391 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.43 
 
 
401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  45.45 
 
 
402 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  45.96 
 
 
391 aa  317  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 
380 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.82 
 
 
400 aa  316  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  45.82 
 
 
392 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.89 
 
 
401 aa  315  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  46.98 
 
 
391 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>