More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4451 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 406 aa  807    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  73.65 
 
 		 406 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  71.18 
 
 		 406 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  71.18 
 
 		 406 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  72.66 
 
 		 406 aa  598  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8569  Acetyl-CoA C-acyltransferase  70.69 
 
 		 406 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  69.95 
 
 		 406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  68.72 
 
 		 405 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0436  acetyl-CoA acetyltransferase  71.25 
 
 		 407 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0908  acetyl-CoA acetyltransferase  67.31 
 
 		 420 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  68.55 
 
 		 406 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0639  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 		 405 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  68.97 
 
 		 406 aa  571  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0851  acetyl-CoA acetyltransferase  67.8 
 
 		 420 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  67 
 
 		 405 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  66.91 
 
 		 414 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  66.26 
 
 		 405 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  66.26 
 
 		 405 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  66.01 
 
 		 405 aa  555  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 		 405 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1371  acetyl-CoA acetyltransferase  65.19 
 
 		 404 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0816349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4616  acetyl-CoA acetyltransferase  68.36 
 
 		 412 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  67.24 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  63.97 
 
 		 407 aa  519  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 		 412 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  63.39 
 
 		 405 aa  504  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1615  acetyl-CoA acetyltransferase  61.18 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.690139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2347  acetyl-CoA acetyltransferase  64.86 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000971024  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  54.52 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  46.52 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 		 398 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  45.05 
 
 		 391 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 		 398 aa  319  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  45.16 
 
 		 395 aa  318  9e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.65 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  41.05 
 
 		 392 aa  315  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.43 
 
 		 390 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  43.41 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  43.68 
 
 		 403 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  45.19 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  44.95 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  42.28 
 
 		 401 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.53 
 
 		 391 aa  310  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  40.49 
 
 		 384 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  43.1 
 
 		 399 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  43.91 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  43.39 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  42.33 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 385 aa  303  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 		 392 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  43.31 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  44.06 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  41.77 
 
 		 394 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  41.77 
 
 		 394 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  42.24 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  42.58 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.65 
 
 		 402 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.63 
 
 		 412 aa  298  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.24 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  42.51 
 
 		 400 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  39.47 
 
 		 391 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.88 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.2 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.99 
 
 		 401 aa  296  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  44.02 
 
 		 399 aa  296  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  39.04 
 
 		 392 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.51 
 
 		 387 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  43.35 
 
 		 378 aa  295  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.99 
 
 		 400 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.96 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3590  acetyl-CoA acetyltransferase  41.25 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.96 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  43.94 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  38.52 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  43.31 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.75 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  42.99 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.87 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.96 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.86 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.69 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.75 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  43.07 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  44.02 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  44.18 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  42.04 
 
 		 398 aa  293  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.68 
 
 		 387 aa  292  8e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  41.79 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.75 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  41.36 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  42.52 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.72 
 
 		 391 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  43.94 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>