40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1956 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  71.46 
 
 		 504 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  86.65 
 
 		 503 aa  885    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 504 aa  1021    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  85.09 
 
 		 503 aa  881    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  61 
 
 		 494 aa  564  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  43.31 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  36.05 
 
 		 515 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  34.9 
 
 		 491 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  35.06 
 
 		 492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  35.06 
 
 		 492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  34.85 
 
 		 492 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  32.55 
 
 		 517 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  33.75 
 
 		 494 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  32.35 
 
 		 506 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  34.44 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  31.77 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  31.77 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  31.77 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  34.84 
 
 		 486 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  32.21 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  31.87 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  30.63 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  29.8 
 
 		 509 aa  143  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 		 797 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  24.76 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0758  hypothetical protein  23.53 
 
 		 357 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2967  hypothetical protein  27.01 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  25.06 
 
 		 385 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  25.52 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  23.3 
 
 		 380 aa  47.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  28.09 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  24.67 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  23.85 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  23.85 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  23.49 
 
 		 390 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  24.25 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>