123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3340 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  79.18 
 
 
492 aa  771    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  79.18 
 
 
492 aa  771    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  84.69 
 
 
491 aa  854    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  78.98 
 
 
492 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
491 aa  996    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  70.04 
 
 
494 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  40.64 
 
 
517 aa  310  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  38.33 
 
 
506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  36.87 
 
 
504 aa  275  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  36.7 
 
 
503 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  37.74 
 
 
474 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  37.74 
 
 
474 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  37.74 
 
 
474 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  38.03 
 
 
486 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  37.69 
 
 
494 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  34.9 
 
 
504 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  35.88 
 
 
503 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  37.5 
 
 
439 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  35.71 
 
 
515 aa  226  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  33.05 
 
 
498 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  33.46 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  33.46 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  33.27 
 
 
509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  32.75 
 
 
509 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  34.25 
 
 
509 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  32.28 
 
 
477 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 
797 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  29.78 
 
 
510 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  23.56 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  25.64 
 
 
394 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  27.92 
 
 
396 aa  60.5  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  23.77 
 
 
387 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  28.34 
 
 
387 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  23.91 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  29.9 
 
 
395 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  26.76 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  27.15 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  25.51 
 
 
379 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  25 
 
 
392 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  22.7 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  24.49 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.53 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.07 
 
 
382 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  25.14 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  25 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  24.23 
 
 
392 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  23.45 
 
 
388 aa  53.5  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  23.47 
 
 
379 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  23.21 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  33.79 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  23.98 
 
 
379 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  27.39 
 
 
390 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  27.39 
 
 
391 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  24.24 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  25 
 
 
379 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  24.72 
 
 
395 aa  50.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  26.96 
 
 
392 aa  50.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0916  acetyl-CoA acetyltransferases  29.66 
 
 
403 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  23.85 
 
 
390 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  24.51 
 
 
392 aa  50.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  30.34 
 
 
393 aa  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.362583  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.73 
 
 
435 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  24.4 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  24.22 
 
 
389 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0148  acetyl-CoA acetyltransferase  31.45 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000426829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.13 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  28.67 
 
 
392 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5510  beta-ketoadipyl CoA thiolase  31.03 
 
 
402 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1517  acetyl-CoA acetyltransferase  33.78 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1540  acetyl-CoA acetyltransferase  33.78 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1691  acetyl-CoA acetyltransferase  28.64 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  24.22 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  23.04 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4493  acetyl-CoA acetyltransferase  27.7 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  26.55 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4580  acetyl-CoA acetyltransferase  27.7 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  30.34 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  31.03 
 
 
387 aa  48.5  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  26.44 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  31.52 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  24.52 
 
 
389 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4876  acetyl-CoA acetyltransferase  28.97 
 
 
403 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.038952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  26.86 
 
 
407 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  30.34 
 
 
396 aa  47.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0758  hypothetical protein  25.31 
 
 
357 aa  47.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2967  hypothetical protein  30.56 
 
 
350 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  31.72 
 
 
394 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  25.36 
 
 
384 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1470  acetyl-CoA acetyltransferase  29.14 
 
 
404 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  26.7 
 
 
388 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1431  acetyl-CoA acetyltransferase  25.5 
 
 
380 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  26.26 
 
 
397 aa  47  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  30.34 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  25 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10876  acetyl-CoA acetyltransferase  30.26 
 
 
412 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0134606  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  28.29 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  29.66 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  27.1 
 
 
392 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  31.29 
 
 
400 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  24.11 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>