37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1809 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 498 aa  1013    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  44.05 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  43.91 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  44.74 
 
 		 494 aa  359  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  43.89 
 
 		 503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  42.08 
 
 		 504 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  36.61 
 
 		 515 aa  239  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  35.44 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  33.82 
 
 		 491 aa  230  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  33.87 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  33.75 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  33.75 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  33.05 
 
 		 491 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  31.65 
 
 		 506 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  33.2 
 
 		 477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  30.65 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  32.56 
 
 		 509 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  32.56 
 
 		 509 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  32.37 
 
 		 509 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  31.72 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  30.64 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  28.8 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  30.1 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  30.1 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  30.1 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.08 
 
 		 510 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.82 
 
 		 797 aa  133  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  28.76 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  27.76 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  29.19 
 
 		 401 aa  48.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  27.53 
 
 		 402 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  27.55 
 
 		 385 aa  47  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  25.13 
 
 		 403 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  25.13 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  28.21 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  20.5 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  34.09 
 
 		 392 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>