35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2502 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 510 aa  1022    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  45.7 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  43.64 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  44.77 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  44.03 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  44.03 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.39 
 
 		 797 aa  356  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  39.09 
 
 		 517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  33.91 
 
 		 506 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  37.77 
 
 		 486 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  31.53 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  31.53 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  31.34 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  34.25 
 
 		 439 aa  196  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  33.87 
 
 		 474 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  33.87 
 
 		 474 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  33.87 
 
 		 474 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  31.56 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  32.4 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  31.1 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  33.88 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  30.97 
 
 		 491 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  33.06 
 
 		 515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  34.08 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  33.41 
 
 		 503 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  31.29 
 
 		 498 aa  156  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  32.85 
 
 		 504 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  32.19 
 
 		 494 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0758  hypothetical protein  26.19 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  27.3 
 
 		 387 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2967  hypothetical protein  29.76 
 
 		 350 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  27.59 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  25 
 
 		 385 aa  47  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5540  putative acetyl-CoA C-acyltransferase  25.31 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  25.42 
 
 		 390 aa  43.5  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>