48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3286 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 474 aa  958    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 474 aa  958    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 474 aa  958    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  68.95 
 
 		 439 aa  596  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  39.34 
 
 		 517 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  37.83 
 
 		 491 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  36.19 
 
 		 491 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  34.66 
 
 		 506 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  35.41 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  35.41 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  35.41 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  36.87 
 
 		 494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  36.28 
 
 		 509 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  37.13 
 
 		 509 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  38.32 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  33.87 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 		 797 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 		 515 aa  187  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  31.77 
 
 		 504 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  32.07 
 
 		 494 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  29.45 
 
 		 504 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  31.49 
 
 		 503 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  31.62 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  30.6 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  30.22 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  24.31 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  25 
 
 		 388 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  26.5 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  25.31 
 
 		 389 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  23.08 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  28.96 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  23.17 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  25.27 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  23.31 
 
 		 380 aa  47.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  24.19 
 
 		 389 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  24.2 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1601  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  22.92 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  23.15 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  25.81 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  28.49 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  29.87 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.78 
 
 		 382 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  25.27 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  22.97 
 
 		 387 aa  43.9  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  30.36 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>