66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2912 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 504 aa  1032    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  70.92 
 
 		 503 aa  710    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  72.85 
 
 		 503 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  71.46 
 
 		 504 aa  726    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 494 aa  571  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  41.48 
 
 		 498 aa  345  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  38.3 
 
 		 491 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  37.33 
 
 		 491 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  37.79 
 
 		 492 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  37.79 
 
 		 492 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  37.58 
 
 		 492 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  34.93 
 
 		 494 aa  250  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  39.55 
 
 		 515 aa  250  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  32.16 
 
 		 517 aa  219  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  34.58 
 
 		 506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  30.04 
 
 		 474 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  30.04 
 
 		 474 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  30.04 
 
 		 474 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  31.33 
 
 		 509 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  31.15 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  31.15 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  33.55 
 
 		 486 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  32.27 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  28.88 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  28.07 
 
 		 509 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  28.04 
 
 		 509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.16 
 
 		 797 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  27.03 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0758  hypothetical protein  24.55 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  25.5 
 
 		 380 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  25.79 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  25.19 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  27.2 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  25.92 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  23.68 
 
 		 379 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  26 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  25.51 
 
 		 383 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  25.62 
 
 		 402 aa  54.3  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  25.32 
 
 		 384 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  24.88 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  31.29 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  22.33 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  22.97 
 
 		 395 aa  51.2  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  26.14 
 
 		 379 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  22.51 
 
 		 390 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  24.09 
 
 		 390 aa  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  24.31 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  25.57 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  24.11 
 
 		 396 aa  49.3  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  27.52 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  24.79 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  25.19 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  26.13 
 
 		 396 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2967  hypothetical protein  24.73 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  22.39 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  27.44 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  23.59 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  23.59 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  23.79 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  23.48 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  23.59 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  26.38 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  23.73 
 
 		 394 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  25.41 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  22.75 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>