71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8290 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
486 aa  949    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  39.68 
 
 
491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  38.03 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  38.95 
 
 
494 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  36.84 
 
 
517 aa  261  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  35.03 
 
 
492 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  35.03 
 
 
492 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  35.44 
 
 
492 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  34.32 
 
 
506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  37.69 
 
 
474 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  37.69 
 
 
474 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  37.69 
 
 
474 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  33.2 
 
 
509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  33.2 
 
 
509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  33.2 
 
 
509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  38.2 
 
 
494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  36.62 
 
 
510 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  35.05 
 
 
503 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  35.94 
 
 
515 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  35.8 
 
 
439 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  34.62 
 
 
504 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  33.41 
 
 
504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  33.98 
 
 
503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  31.67 
 
 
509 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  30.87 
 
 
509 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  33.26 
 
 
498 aa  176  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
797 aa  173  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  26.92 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  28.89 
 
 
383 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  25.88 
 
 
380 aa  61.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  32.97 
 
 
388 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  31.49 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2967  hypothetical protein  27.67 
 
 
350 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  24.78 
 
 
382 aa  53.5  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  35.77 
 
 
389 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  30.39 
 
 
389 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  26.78 
 
 
388 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  25.4 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  29.86 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  27.87 
 
 
383 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  31.88 
 
 
389 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  31.91 
 
 
387 aa  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  32.33 
 
 
389 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  35.11 
 
 
395 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  32.29 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  25.44 
 
 
379 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  27.09 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  24.04 
 
 
383 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  25.44 
 
 
379 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  27.6 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  24.78 
 
 
379 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  25.79 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  32.47 
 
 
394 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  24.37 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  26.27 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  31.28 
 
 
389 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  25.32 
 
 
383 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  28.88 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  24.63 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  25.59 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  28.44 
 
 
389 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  26.04 
 
 
397 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  28.71 
 
 
389 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  28.93 
 
 
389 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  25.52 
 
 
394 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  31.21 
 
 
390 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  29.95 
 
 
406 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  30.08 
 
 
389 aa  43.5  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  25 
 
 
379 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>