42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1858 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  72.85 
 
 		 504 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  86.06 
 
 		 503 aa  882    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  85.09 
 
 		 504 aa  881    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 503 aa  1023    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  60.4 
 
 		 494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  43.54 
 
 		 498 aa  362  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  37.63 
 
 		 515 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  36.7 
 
 		 491 aa  257  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  34.16 
 
 		 491 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  36.34 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  36.34 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  36.13 
 
 		 492 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  34.52 
 
 		 494 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  33.72 
 
 		 517 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 506 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  34.41 
 
 		 486 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  31.89 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  33.88 
 
 		 510 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  31.49 
 
 		 474 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  31.49 
 
 		 474 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  31.49 
 
 		 474 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  31.35 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  31.35 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  30.95 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  30.22 
 
 		 439 aa  144  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  30.66 
 
 		 509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  27.77 
 
 		 509 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.57 
 
 		 797 aa  117  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  24.47 
 
 		 388 aa  73.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0758  hypothetical protein  23.06 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  23.03 
 
 		 380 aa  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  23.92 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  23.6 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  24.68 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  23.63 
 
 		 379 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  25.52 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  24.79 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  28.65 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  22.36 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  23.08 
 
 		 383 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2967  hypothetical protein  30.43 
 
 		 350 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  26.41 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>