65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4866 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  71.2 
 
 
509 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  86.42 
 
 
509 aa  874    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
509 aa  1030    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  71.68 
 
 
509 aa  732    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  71.68 
 
 
509 aa  732    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.25 
 
 
797 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  44.77 
 
 
510 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  35.35 
 
 
517 aa  267  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  34.23 
 
 
506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  34.44 
 
 
491 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  31.94 
 
 
492 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  31.94 
 
 
492 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  32.14 
 
 
492 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 
491 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  37.13 
 
 
474 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  37.13 
 
 
474 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  37.13 
 
 
474 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  32.67 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  33.56 
 
 
439 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  36.52 
 
 
477 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  31.47 
 
 
486 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  30.14 
 
 
504 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  28.35 
 
 
498 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  31.57 
 
 
515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  28.38 
 
 
503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  29.27 
 
 
504 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  29.51 
 
 
494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  26.85 
 
 
503 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.7 
 
 
382 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  27.51 
 
 
389 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  31.06 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  27.32 
 
 
387 aa  54.7  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  25.72 
 
 
393 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  26.07 
 
 
389 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  28.27 
 
 
389 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  28.79 
 
 
398 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7151  acetyl-CoA acetyltransferase  24.16 
 
 
405 aa  50.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  33.8 
 
 
384 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  28.79 
 
 
398 aa  50.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  28 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  27.27 
 
 
386 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  29.55 
 
 
413 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  24.51 
 
 
389 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  28.03 
 
 
390 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  23.94 
 
 
388 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  30.3 
 
 
431 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  24.46 
 
 
388 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  28.81 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  24.87 
 
 
389 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  24.52 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  23.71 
 
 
402 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  27.27 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  23.71 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  25.93 
 
 
388 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  23.71 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  26.67 
 
 
397 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  30.26 
 
 
393 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  31.58 
 
 
406 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  25.25 
 
 
401 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  26.24 
 
 
387 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  30.61 
 
 
405 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  26.14 
 
 
395 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  25.71 
 
 
394 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  27.88 
 
 
396 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  23.72 
 
 
388 aa  43.5  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>