More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5179 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6729  Acetyl-CoA C-acyltransferase  80.26 
 
 		 399 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal  0.313674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  85.39 
 
 		 402 aa  682    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 405 aa  809    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  92.95 
 
 		 400 aa  731    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  78.89 
 
 		 407 aa  638    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  76.83 
 
 		 406 aa  634    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1760  acetyl-CoA acetyltransferase  78.5 
 
 		 398 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2267  acetyl-CoA acetyltransferase  78.87 
 
 		 394 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0453724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  75.82 
 
 		 404 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  78.72 
 
 		 399 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  76.57 
 
 		 441 aa  627  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  76.21 
 
 		 398 aa  614  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1903  thiolase  79.23 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0201769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  76.21 
 
 		 398 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3548  acetyl-CoA acetyltransferase  74.55 
 
 		 435 aa  608  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000428807  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  73.72 
 
 		 431 aa  598  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  73.1 
 
 		 416 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0190156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  75.77 
 
 		 443 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  71.83 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  74.94 
 
 		 413 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16370  acetyl-CoA acetyltransferase  70.51 
 
 		 414 aa  565  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  72.45 
 
 		 403 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  69.74 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  64.6 
 
 		 407 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.908715  normal  0.564099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  58.1 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.43 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.06 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  40.3 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  44.03 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.04 
 
 		 401 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.04 
 
 		 401 aa  289  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.04 
 
 		 401 aa  289  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.39 
 
 		 402 aa  288  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.04 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  43.49 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.04 
 
 		 406 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.9 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.61 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  41.9 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.15 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  41.54 
 
 		 399 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  42.55 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.71 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.86 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.85 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.59 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.59 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  41.15 
 
 		 398 aa  279  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.59 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3594  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.28 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  42.54 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.01 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  39.85 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.13 
 
 		 387 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.95 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.21 
 
 		 401 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3817  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.02 
 
 		 400 aa  276  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342628  normal  0.265145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  42.03 
 
 		 399 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.39 
 
 		 387 aa  275  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  40 
 
 		 391 aa  275  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.33 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.59 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.33 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.65 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.4 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  39.33 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  40 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.33 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.33 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.29 
 
 		 406 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.33 
 
 		 387 aa  272  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.25 
 
 		 402 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.28 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.65 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.78 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.56 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.3 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.3 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42 
 
 		 402 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.85 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.86 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1847  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.66 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.227996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.22 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.56 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.3 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.3 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.6 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.85 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.14 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.3 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 		 404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.85 
 
 		 387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.67 
 
 		 401 aa  268  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.61 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.64 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.14 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>