More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3017 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  81.12 
 
 		 407 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6729  Acetyl-CoA C-acyltransferase  80.51 
 
 		 399 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal  0.313674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  85.75 
 
 		 402 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  92.95 
 
 		 405 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 400 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1760  acetyl-CoA acetyltransferase  78.09 
 
 		 398 aa  628  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  76.71 
 
 		 406 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2267  acetyl-CoA acetyltransferase  78.61 
 
 		 394 aa  624  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0453724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  78.21 
 
 		 399 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  78.46 
 
 		 398 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  77.89 
 
 		 441 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  78.46 
 
 		 398 aa  621  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3548  acetyl-CoA acetyltransferase  77.04 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000428807  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 		 404 aa  616  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1903  thiolase  79.33 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0201769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  74.18 
 
 		 416 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0190156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  73.28 
 
 		 431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  75.57 
 
 		 443 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  73.28 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  74.36 
 
 		 413 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16370  acetyl-CoA acetyltransferase  70.59 
 
 		 414 aa  569  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  72.31 
 
 		 403 aa  554  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  69.82 
 
 		 405 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  64.6 
 
 		 407 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.908715  normal  0.564099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  58.35 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  44.69 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.69 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  42.71 
 
 		 400 aa  302  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 		 403 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.53 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  43.03 
 
 		 399 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.53 
 
 		 404 aa  296  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.29 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.86 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.18 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.28 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.36 
 
 		 406 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.28 
 
 		 401 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.28 
 
 		 401 aa  293  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  43.49 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.65 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.67 
 
 		 401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.39 
 
 		 402 aa  289  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  43.27 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  43.11 
 
 		 402 aa  285  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.54 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.15 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.9 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.41 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.85 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  43.29 
 
 		 399 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.87 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.1 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.85 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.15 
 
 		 401 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.56 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.9 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.42 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.18 
 
 		 401 aa  279  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.26 
 
 		 400 aa  278  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.46 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.33 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.24 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.95 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.1 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.25 
 
 		 402 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.74 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.92 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.77 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.03 
 
 		 406 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 		 390 aa  276  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.01 
 
 		 391 aa  276  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  39.33 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  39.33 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0472  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.08 
 
 		 400 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0423781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  43.93 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.42 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0447  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.08 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.8 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.75 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.69 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.69 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.69 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.39 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  44.76 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1847  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.92 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.227996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.57 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.65 
 
 		 400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.15 
 
 		 400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.07 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.65 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.07 
 
 		 387 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.82 
 
 		 387 aa  272  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>