More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3548 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3548  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 435 aa  877    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000428807  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  78.64 
 
 		 407 aa  651    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  78.55 
 
 		 406 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6729  Acetyl-CoA C-acyltransferase  77.41 
 
 		 399 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal  0.313674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  77.75 
 
 		 416 aa  630  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0190156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2267  acetyl-CoA acetyltransferase  78.61 
 
 		 394 aa  625  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0453724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1760  acetyl-CoA acetyltransferase  75.88 
 
 		 398 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  73.82 
 
 		 404 aa  624  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  72.95 
 
 		 441 aa  620  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  74.81 
 
 		 399 aa  614  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  72.02 
 
 		 443 aa  617  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  75.82 
 
 		 398 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  75.06 
 
 		 398 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  73.54 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  77.04 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1903  thiolase  76.13 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0201769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16370  acetyl-CoA acetyltransferase  70.94 
 
 		 414 aa  598  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  72.8 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  76.47 
 
 		 402 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  74.02 
 
 		 413 aa  594  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  73.5 
 
 		 403 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  74.55 
 
 		 405 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  71.54 
 
 		 405 aa  557  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  68.27 
 
 		 407 aa  544  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.908715  normal  0.564099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  58.76 
 
 		 397 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.09 
 
 		 387 aa  299  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.28 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.84 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.35 
 
 		 387 aa  288  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  41.85 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.84 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.31 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43 
 
 		 402 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.93 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.57 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.74 
 
 		 404 aa  279  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.19 
 
 		 391 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 		 387 aa  279  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  41.39 
 
 		 411 aa  278  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.41 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.45 
 
 		 401 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.79 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.94 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  42.08 
 
 		 403 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.45 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.45 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.45 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  40.44 
 
 		 398 aa  276  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.01 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 		 406 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.51 
 
 		 387 aa  274  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.85 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  39.85 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  272  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.24 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  41.03 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.9 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.19 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.98 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  41.03 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  39.45 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  41.03 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.6 
 
 		 401 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  41.65 
 
 		 402 aa  268  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  37.93 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  43.49 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.3 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.06 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.19 
 
 		 400 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.19 
 
 		 400 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.19 
 
 		 400 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.19 
 
 		 400 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.32 
 
 		 374 aa  266  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.19 
 
 		 405 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 		 387 aa  266  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>