More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2836 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6729  Acetyl-CoA C-acyltransferase  81 
 
 		 399 aa  658    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal  0.313674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1760  acetyl-CoA acetyltransferase  84.21 
 
 		 398 aa  689    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597198  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1903  thiolase  89.17 
 
 		 400 aa  702    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0201769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  79.13 
 
 		 406 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  78.84 
 
 		 407 aa  647    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  78.63 
 
 		 441 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2267  acetyl-CoA acetyltransferase  80.15 
 
 		 394 aa  637    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0453724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 399 aa  803    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  74.75 
 
 		 404 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  75.13 
 
 		 398 aa  614  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3548  acetyl-CoA acetyltransferase  74.81 
 
 		 435 aa  613  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000428807  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  75.13 
 
 		 398 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  78.21 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  73.3 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  72.08 
 
 		 431 aa  594  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  75.38 
 
 		 402 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  78.72 
 
 		 405 aa  594  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  73.55 
 
 		 443 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  72.12 
 
 		 416 aa  581  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0190156  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16370  acetyl-CoA acetyltransferase  70.74 
 
 		 414 aa  569  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  72.45 
 
 		 413 aa  567  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  69.77 
 
 		 403 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  68.03 
 
 		 405 aa  538  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  63.78 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.908715  normal  0.564099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  58.48 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.9 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  39.7 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.9 
 
 		 401 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  42.68 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.9 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.9 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.64 
 
 		 402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  43.83 
 
 		 411 aa  285  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.12 
 
 		 404 aa  285  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.5 
 
 		 401 aa  285  9e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.55 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  38.27 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.92 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.8 
 
 		 401 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.9 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  41.94 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.69 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.75 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.79 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  41.98 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.75 
 
 		 401 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  42.53 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.25 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.5 
 
 		 401 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.5 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  42.03 
 
 		 390 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  42.68 
 
 		 409 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.53 
 
 		 399 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  42.39 
 
 		 390 aa  273  6e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.15 
 
 		 405 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  39.55 
 
 		 399 aa  272  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.04 
 
 		 402 aa  272  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  41.58 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.33 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.75 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.77 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  39.49 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.44 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.84 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.66 
 
 		 387 aa  270  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.02 
 
 		 387 aa  270  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3817  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.67 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342628  normal  0.265145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.4 
 
 		 387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  40.86 
 
 		 390 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  39.21 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.44 
 
 		 391 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.69 
 
 		 387 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3594  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.4 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.6 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.5 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.48 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.5 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.71 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  37.73 
 
 		 403 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.59 
 
 		 400 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.69 
 
 		 406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.18 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.86 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.18 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.18 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.18 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.66 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.92 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.08 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.75 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.4 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.75 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.66 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.75 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.75 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.75 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.75 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.53 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  41.27 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>