More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1403 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 
397 aa  815    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2267  acetyl-CoA acetyltransferase  60.87 
 
 
394 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0453724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6729  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.44 
 
 
399 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal  0.313674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  58.48 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  60.41 
 
 
407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1760  acetyl-CoA acetyltransferase  59.75 
 
 
398 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3548  acetyl-CoA acetyltransferase  58.76 
 
 
435 aa  468  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000428807  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  59.08 
 
 
441 aa  461  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  59.09 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  59.34 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  57.36 
 
 
404 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  58.08 
 
 
406 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.64 
 
 
402 aa  454  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1903  thiolase  59.24 
 
 
400 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0201769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  58.35 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  55.78 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0190156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  58.35 
 
 
431 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  59.13 
 
 
403 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  55.33 
 
 
407 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.908715  normal  0.564099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  57.44 
 
 
413 aa  440  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  57.11 
 
 
396 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  58.35 
 
 
443 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  58.1 
 
 
405 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16370  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
414 aa  428  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30355  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
405 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  42.3 
 
 
398 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  39.56 
 
 
400 aa  286  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.65 
 
 
387 aa  286  5.999999999999999e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  41.28 
 
 
401 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.94 
 
 
391 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.65 
 
 
387 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  40.89 
 
 
403 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.61 
 
 
401 aa  276  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  40.39 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.56 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.74 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.36 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 
387 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.12 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.12 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 
387 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.45 
 
 
401 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.16 
 
 
404 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.51 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.1 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.29 
 
 
404 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  38.56 
 
 
398 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.09 
 
 
387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.59 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  39.26 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 
391 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  41.21 
 
 
399 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.8 
 
 
391 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 
391 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 
391 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.07 
 
 
387 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  38.77 
 
 
398 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  41.71 
 
 
390 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  38.06 
 
 
399 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  40.24 
 
 
411 aa  265  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.66 
 
 
399 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.95 
 
 
401 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  37.81 
 
 
399 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.85 
 
 
387 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.9 
 
 
400 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.46 
 
 
387 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.81 
 
 
412 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.34 
 
 
387 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.07 
 
 
387 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  37.81 
 
 
398 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  39.52 
 
 
414 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.07 
 
 
387 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.09 
 
 
387 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  37.06 
 
 
401 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.59 
 
 
391 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.51 
 
 
390 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.23 
 
 
387 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.13 
 
 
387 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.07 
 
 
387 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.07 
 
 
387 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.74 
 
 
386 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.39 
 
 
387 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.34 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.35 
 
 
374 aa  263  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.34 
 
 
391 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.92 
 
 
387 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  39.07 
 
 
387 aa  262  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  39.07 
 
 
387 aa  262  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.91 
 
 
400 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.59 
 
 
391 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.07 
 
 
387 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.07 
 
 
387 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.25 
 
 
390 aa  262  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.83 
 
 
387 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.14 
 
 
387 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.14 
 
 
387 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.9 
 
 
391 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>