More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6777 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
404 aa  818    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  79.7 
 
 
398 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  78.45 
 
 
407 aa  647    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  78.66 
 
 
406 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6729  Acetyl-CoA C-acyltransferase  77.97 
 
 
399 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal  0.313674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  81.06 
 
 
398 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  77.72 
 
 
441 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1760  acetyl-CoA acetyltransferase  77.53 
 
 
398 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  76.13 
 
 
396 aa  624  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3548  acetyl-CoA acetyltransferase  73.82 
 
 
435 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000428807  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2267  acetyl-CoA acetyltransferase  76.92 
 
 
394 aa  617  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0453724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  74.75 
 
 
399 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  74.18 
 
 
431 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  73.72 
 
 
416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0190156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  76.01 
 
 
402 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1903  thiolase  75.69 
 
 
400 aa  598  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0201769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  75.82 
 
 
405 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 
400 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  74.05 
 
 
443 aa  593  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  74.49 
 
 
413 aa  590  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16370  acetyl-CoA acetyltransferase  69.74 
 
 
414 aa  570  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30355  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  70 
 
 
405 aa  561  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  70.48 
 
 
403 aa  552  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  63.89 
 
 
407 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.908715  normal  0.564099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  57.36 
 
 
397 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  42.11 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.33 
 
 
387 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.82 
 
 
387 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.73 
 
 
402 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.31 
 
 
387 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  42.68 
 
 
398 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  42.57 
 
 
399 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.18 
 
 
404 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  42.18 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.83 
 
 
401 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  42.26 
 
 
401 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.83 
 
 
401 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.83 
 
 
401 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.83 
 
 
401 aa  288  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.54 
 
 
387 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.79 
 
 
387 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.54 
 
 
387 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  41.79 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  41.79 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.07 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  42.55 
 
 
411 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.56 
 
 
387 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  42.33 
 
 
403 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.54 
 
 
387 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.15 
 
 
404 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.54 
 
 
387 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 
387 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 
387 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 
387 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 
387 aa  279  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 
387 aa  279  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 
387 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 
387 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  41.28 
 
 
387 aa  279  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 
387 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.75 
 
 
406 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 
387 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 
387 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 
387 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 
387 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 
387 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 
387 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 
387 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.31 
 
 
387 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.36 
 
 
406 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 
387 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 
387 aa  276  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.03 
 
 
387 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  38.52 
 
 
404 aa  275  8e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.51 
 
 
387 aa  275  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 
387 aa  275  9e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.51 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.62 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.92 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  42.11 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 
387 aa  273  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 
387 aa  273  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 
387 aa  273  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.77 
 
 
387 aa  272  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42 
 
 
401 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.05 
 
 
412 aa  272  9e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  40.84 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.46 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 
390 aa  270  4e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.11 
 
 
391 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.29 
 
 
400 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.75 
 
 
401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0810  acetyl-CoA acetyltransferase  39.66 
 
 
399 aa  269  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  41.98 
 
 
412 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  37.94 
 
 
401 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  39.39 
 
 
424 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  40.49 
 
 
398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.85 
 
 
401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.74 
 
 
387 aa  266  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>