More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4045 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  84.24 
 
 		 387 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  83.98 
 
 		 387 aa  683    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.5 
 
 		 387 aa  687    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.24 
 
 		 387 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  80.62 
 
 		 387 aa  641    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  81.91 
 
 		 387 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.24 
 
 		 387 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.24 
 
 		 387 aa  686    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  83.72 
 
 		 387 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.5 
 
 		 387 aa  688    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  83.46 
 
 		 387 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.24 
 
 		 387 aa  685    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  83.72 
 
 		 387 aa  683    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  85.53 
 
 		 387 aa  692    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  81.91 
 
 		 387 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  84.24 
 
 		 387 aa  685    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  83.72 
 
 		 387 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  81.91 
 
 		 387 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.24 
 
 		 387 aa  674    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.24 
 
 		 387 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  96.38 
 
 		 387 aa  766    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 		 387 aa  788    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  84.24 
 
 		 387 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.39 
 
 		 387 aa  614  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.91 
 
 		 387 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.54 
 
 		 387 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.26 
 
 		 391 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.5 
 
 		 387 aa  594  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.5 
 
 		 387 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.09 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.09 
 
 		 387 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.13 
 
 		 387 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.02 
 
 		 387 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.09 
 
 		 387 aa  584  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.83 
 
 		 387 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.6 
 
 		 374 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.09 
 
 		 387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.32 
 
 		 387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.58 
 
 		 387 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.58 
 
 		 387 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.58 
 
 		 387 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.58 
 
 		 387 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.58 
 
 		 387 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.99 
 
 		 387 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.51 
 
 		 386 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.44 
 
 		 386 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.67 
 
 		 391 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.41 
 
 		 391 aa  524  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.36 
 
 		 391 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.36 
 
 		 391 aa  514  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.32 
 
 		 391 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.32 
 
 		 391 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.32 
 
 		 391 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.32 
 
 		 391 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.84 
 
 		 391 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.84 
 
 		 391 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.45 
 
 		 391 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.84 
 
 		 391 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.99 
 
 		 390 aa  498  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.47 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.76 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.21 
 
 		 390 aa  487  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.16 
 
 		 391 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2392  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.24 
 
 		 392 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 390 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  49 
 
 		 403 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  48.51 
 
 		 401 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 		 390 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.16 
 
 		 402 aa  338  7e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  48.4 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  47.17 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.44 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  48.1 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  47.73 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  46.7 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.47 
 
 		 391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  46.91 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.07 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1850  acetyl-CoA acetyltransferase  48.44 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0860888  normal  0.20671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.03 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.91 
 
 		 402 aa  322  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.03 
 
 		 401 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.03 
 
 		 401 aa  322  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.03 
 
 		 401 aa  322  7e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  47.22 
 
 		 390 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  46.95 
 
 		 390 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  46.97 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  46.33 
 
 		 392 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  47.91 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  47.77 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  44.61 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  45.16 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>