More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2392 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2392  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 
392 aa  802    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.77 
 
 
391 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.27 
 
 
390 aa  522  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.52 
 
 
390 aa  524  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.94 
 
 
391 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.85 
 
 
390 aa  519  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.22 
 
 
391 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.21 
 
 
387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.94 
 
 
391 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.68 
 
 
391 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.16 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.68 
 
 
391 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.68 
 
 
391 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.92 
 
 
391 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.03 
 
 
387 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.66 
 
 
391 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.68 
 
 
387 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.92 
 
 
391 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.73 
 
 
387 aa  508  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.42 
 
 
387 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.73 
 
 
387 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.25 
 
 
387 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.73 
 
 
387 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.66 
 
 
391 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.73 
 
 
387 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.66 
 
 
391 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.73 
 
 
387 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.47 
 
 
387 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.73 
 
 
387 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.73 
 
 
387 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.73 
 
 
387 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.47 
 
 
387 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.44 
 
 
386 aa  498  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.86 
 
 
387 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.86 
 
 
387 aa  494  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.24 
 
 
387 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.5 
 
 
387 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.24 
 
 
387 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.12 
 
 
387 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  60.52 
 
 
387 aa  491  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.12 
 
 
387 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.12 
 
 
387 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.24 
 
 
387 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.5 
 
 
387 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
387 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.24 
 
 
387 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.46 
 
 
387 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  62.24 
 
 
387 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.24 
 
 
387 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.46 
 
 
387 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.46 
 
 
387 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.46 
 
 
387 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  61.98 
 
 
387 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.2 
 
 
387 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  60.36 
 
 
391 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.14 
 
 
387 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.72 
 
 
387 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.1 
 
 
391 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.88 
 
 
387 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.79 
 
 
391 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  60.68 
 
 
387 aa  480  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  58.96 
 
 
386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.88 
 
 
387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.73 
 
 
374 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  46.95 
 
 
390 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  48.29 
 
 
391 aa  322  7e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  47.89 
 
 
391 aa  322  8e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 
390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
398 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  44.47 
 
 
399 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 
403 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  43.84 
 
 
398 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  47.16 
 
 
402 aa  316  5e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.66 
 
 
400 aa  315  7e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  46.02 
 
 
385 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 
385 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 
401 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.76 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  45.76 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.32 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  44.44 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  45.5 
 
 
385 aa  305  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  44.95 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  46.84 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  45.3 
 
 
402 aa  302  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  43.53 
 
 
424 aa  302  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.13 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.94 
 
 
412 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
396 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 
380 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  44.95 
 
 
396 aa  299  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  45.2 
 
 
391 aa  294  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.89 
 
 
391 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.28 
 
 
404 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.72 
 
 
401 aa  292  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  44.03 
 
 
395 aa  292  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  42.5 
 
 
390 aa  292  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
392 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.06 
 
 
405 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  42.96 
 
 
406 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>