More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1850 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1850  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
380 aa  773    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0860888  normal  0.20671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  76.94 
 
 
378 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  75.34 
 
 
378 aa  572  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0736  acetyl-CoA acetyltransferase  71.85 
 
 
379 aa  527  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1431  acetyl-CoA acetyltransferase  65.95 
 
 
380 aa  498  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2900  acetyl-CoA acetyltransferase  63.68 
 
 
381 aa  483  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  48.96 
 
 
390 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  47.92 
 
 
390 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.7 
 
 
387 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.44 
 
 
387 aa  331  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.92 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.92 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.18 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.92 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.92 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.14 
 
 
387 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.92 
 
 
387 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.14 
 
 
387 aa  322  7e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.88 
 
 
387 aa  322  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.01 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.14 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.18 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.75 
 
 
387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.88 
 
 
387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.4 
 
 
387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.14 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.32 
 
 
398 aa  318  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.88 
 
 
387 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  45.57 
 
 
398 aa  318  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.95 
 
 
391 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  47.14 
 
 
387 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  47.14 
 
 
387 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.88 
 
 
387 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  46.61 
 
 
387 aa  315  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  46.37 
 
 
394 aa  314  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.75 
 
 
387 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.09 
 
 
387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  45.97 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  44.19 
 
 
402 aa  312  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.83 
 
 
387 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.36 
 
 
424 aa  312  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.83 
 
 
387 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.83 
 
 
387 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.17 
 
 
386 aa  312  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  45.09 
 
 
393 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.27 
 
 
387 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  46.1 
 
 
393 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  45.71 
 
 
390 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  45 
 
 
411 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  45.71 
 
 
390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.49 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.49 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  44.95 
 
 
393 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
393 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.49 
 
 
387 aa  309  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 
403 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 
399 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.49 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.68 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.19 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  44.02 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.88 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.23 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.23 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.09 
 
 
387 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  46.41 
 
 
392 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  46.34 
 
 
390 aa  306  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  43.9 
 
 
390 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  43.64 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.74 
 
 
391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43 
 
 
405 aa  305  6e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.83 
 
 
386 aa  305  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  45.71 
 
 
390 aa  305  7e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  45.95 
 
 
378 aa  305  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 
392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  45.71 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  44.89 
 
 
390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  44.84 
 
 
393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  44.05 
 
 
400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.83 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.83 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  45.09 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.92 
 
 
402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.83 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.83 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.83 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  45.87 
 
 
378 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  45.38 
 
 
393 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  45.34 
 
 
393 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  44.65 
 
 
395 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>