More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0389 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  88.1 
 
 
378 aa  682    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
378 aa  758    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0736  acetyl-CoA acetyltransferase  75.47 
 
 
379 aa  567  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1850  acetyl-CoA acetyltransferase  76.94 
 
 
380 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0860888  normal  0.20671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1431  acetyl-CoA acetyltransferase  70.4 
 
 
380 aa  530  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2900  acetyl-CoA acetyltransferase  68.52 
 
 
381 aa  518  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.4 
 
 
391 aa  322  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  45.71 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  45.82 
 
 
402 aa  322  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  47.01 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.64 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.32 
 
 
399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  46.74 
 
 
390 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.86 
 
 
387 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  46.21 
 
 
390 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.48 
 
 
390 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  47 
 
 
387 aa  315  9e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.6 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.12 
 
 
387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  45.6 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  48.26 
 
 
395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.55 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  46.35 
 
 
403 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 
401 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
385 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.6 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.36 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.1 
 
 
398 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.07 
 
 
387 aa  309  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.29 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.29 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.29 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.6 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.45 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.29 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.81 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.29 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.81 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.81 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 
404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.55 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.19 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  44.36 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 
411 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.07 
 
 
387 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 
384 aa  306  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  44.56 
 
 
390 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.29 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  46.09 
 
 
378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  45.18 
 
 
393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.55 
 
 
387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  45.38 
 
 
378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.55 
 
 
403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.14 
 
 
386 aa  305  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.09 
 
 
387 aa  305  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.55 
 
 
387 aa  305  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.07 
 
 
387 aa  305  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  45.81 
 
 
387 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  45.81 
 
 
387 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.81 
 
 
387 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.78 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.34 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.81 
 
 
387 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  46.52 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.55 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  44.92 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.48 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.03 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  45.29 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.48 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.7 
 
 
402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.48 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.48 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.48 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.7 
 
 
402 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  44.56 
 
 
390 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45 
 
 
400 aa  302  6.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.15 
 
 
424 aa  302  7.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06175  acetyl-CoA acyltransferase  45.9 
 
 
396 aa  302  8.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.8 
 
 
401 aa  301  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
390 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  44 
 
 
390 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.64 
 
 
401 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.15 
 
 
405 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  45.6 
 
 
388 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.41 
 
 
404 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.44 
 
 
401 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.64 
 
 
401 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.03 
 
 
387 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.03 
 
 
387 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.03 
 
 
387 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.36 
 
 
400 aa  299  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.89 
 
 
391 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.53 
 
 
402 aa  298  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  43.54 
 
 
383 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.7 
 
 
397 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>