More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0031 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
386 aa  773    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  70.57 
 
 
381 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  70.05 
 
 
379 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  65.98 
 
 
385 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  68.19 
 
 
390 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  65.72 
 
 
385 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  65.72 
 
 
385 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  66.49 
 
 
385 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  65.21 
 
 
385 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  65.89 
 
 
387 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  68.03 
 
 
389 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  68.19 
 
 
390 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  65.97 
 
 
383 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  65.97 
 
 
383 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  65.97 
 
 
383 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  66.15 
 
 
381 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  64.29 
 
 
390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  64.19 
 
 
373 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 
391 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  59.53 
 
 
385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  59.05 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  57.4 
 
 
381 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  58.02 
 
 
394 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  56.01 
 
 
392 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.64 
 
 
397 aa  421  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  57.14 
 
 
381 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  54.82 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  57.79 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  57.62 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  58.27 
 
 
394 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  54.96 
 
 
394 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  55.89 
 
 
397 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.52 
 
 
394 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  58.52 
 
 
394 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  56.33 
 
 
385 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 
382 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.06 
 
 
395 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.66 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  53.73 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  53.9 
 
 
392 aa  401  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  55 
 
 
397 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 
392 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  55.61 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  53.05 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
391 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  54.48 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  52.79 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 
391 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.26 
 
 
392 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 
384 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  54.66 
 
 
380 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  54.12 
 
 
390 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  53.89 
 
 
380 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  54.52 
 
 
380 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  54.26 
 
 
387 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  54.36 
 
 
393 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  53.95 
 
 
392 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  52.06 
 
 
389 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 
390 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.23 
 
 
383 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  54.55 
 
 
391 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  51.53 
 
 
394 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  51.68 
 
 
377 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
383 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  48.74 
 
 
395 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
382 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  53.73 
 
 
390 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  51.93 
 
 
390 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  51.42 
 
 
377 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
386 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
386 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
390 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
386 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
389 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
386 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  51.94 
 
 
383 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  52.2 
 
 
387 aa  362  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  51.94 
 
 
385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  51.42 
 
 
382 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
383 aa  359  6e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
382 aa  358  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  49.35 
 
 
382 aa  351  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
385 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  46.82 
 
 
384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 
383 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  47.67 
 
 
407 aa  341  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  47.8 
 
 
393 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  46.39 
 
 
384 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 
395 aa  332  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.77 
 
 
398 aa  332  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  45.83 
 
 
402 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 
398 aa  329  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  44.67 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3409  acetyl-CoA acetyltransferase  45.1 
 
 
401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1431  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 
380 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  45.24 
 
 
390 aa  317  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>