More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0912 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
385 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  65.62 
 
 
383 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  65.62 
 
 
383 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  65.62 
 
 
383 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  67.92 
 
 
373 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  65.18 
 
 
387 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  63.32 
 
 
381 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  62.89 
 
 
390 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  59.74 
 
 
381 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  59.53 
 
 
386 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  59.37 
 
 
379 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  55.73 
 
 
385 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.47 
 
 
385 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  55.47 
 
 
385 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  55.73 
 
 
385 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  54.95 
 
 
385 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  57.22 
 
 
389 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  55.67 
 
 
390 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  56.44 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  53.23 
 
 
390 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  54.01 
 
 
391 aa  391  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  51.28 
 
 
394 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  52.88 
 
 
380 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  50.26 
 
 
397 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  52.36 
 
 
381 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  51.32 
 
 
379 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.04 
 
 
395 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
385 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
385 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.59 
 
 
392 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 
382 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
386 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
392 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  51.96 
 
 
380 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
381 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
382 aa  364  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.15 
 
 
423 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  49.87 
 
 
392 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
383 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
392 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 
397 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.62 
 
 
397 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  49.48 
 
 
392 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  50.77 
 
 
394 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  50.91 
 
 
380 aa  359  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 
397 aa  358  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  50.88 
 
 
399 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  49.22 
 
 
390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  52.42 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.16 
 
 
394 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 
397 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  52.16 
 
 
394 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  47.93 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  47.15 
 
 
392 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  48.31 
 
 
384 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.48 
 
 
383 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  48.7 
 
 
386 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  48.7 
 
 
386 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  48.7 
 
 
386 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  48.71 
 
 
385 aa  342  8e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 
394 aa  339  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  47.92 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 
392 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  47.4 
 
 
383 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  45.64 
 
 
393 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  45.55 
 
 
393 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 
392 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  45.48 
 
 
390 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  47.55 
 
 
383 aa  326  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  47.78 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  43.93 
 
 
391 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 
395 aa  324  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  43.93 
 
 
391 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  43.93 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  47.4 
 
 
387 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  46.91 
 
 
395 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  43.67 
 
 
391 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  45.88 
 
 
389 aa  316  5e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  47.15 
 
 
382 aa  314  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  46.09 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  46.59 
 
 
392 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  45.1 
 
 
385 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  46.41 
 
 
391 aa  312  7.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  43.49 
 
 
389 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
378 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  45.57 
 
 
407 aa  309  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  46.03 
 
 
377 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 
377 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  43.97 
 
 
398 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  43.47 
 
 
378 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
398 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  43.61 
 
 
399 aa  299  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  42.6 
 
 
390 aa  298  9e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  43.75 
 
 
382 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  43.12 
 
 
383 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  42.43 
 
 
402 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  43.94 
 
 
392 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  44.44 
 
 
398 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>