More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5432 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  79.34 
 
 		 392 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 392 aa  798    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  78.06 
 
 		 390 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  78.17 
 
 		 394 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  77.1 
 
 		 391 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  75.57 
 
 		 391 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 		 392 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  74.55 
 
 		 391 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  72.45 
 
 		 390 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  75.26 
 
 		 392 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 		 390 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  64.54 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  68.38 
 
 		 391 aa  511  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  65.65 
 
 		 390 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 		 381 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  55.1 
 
 		 381 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 		 377 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 		 380 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  54.68 
 
 		 384 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.59 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.3 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 		 383 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  54.71 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  53.54 
 
 		 385 aa  401  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  51.77 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  52.78 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  52.41 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  54.23 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.67 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  52.67 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  52.67 
 
 		 385 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  52.1 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 		 386 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  51.91 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  50.87 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  50.62 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  54.21 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  51.38 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  50.63 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  50.62 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  49.49 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  51.24 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.86 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  50.86 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  51.86 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.62 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.87 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.9 
 
 		 383 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  50.9 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  51.23 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  51.36 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  50.9 
 
 		 383 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  50.12 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  52.17 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  48.28 
 
 		 392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  47.52 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  48.77 
 
 		 392 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.54 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  47.73 
 
 		 382 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  52.02 
 
 		 390 aa  352  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 373 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 		 393 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 		 385 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 		 395 aa  328  7e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  46.46 
 
 		 384 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2801  acetyl-CoA acetyltransferase  45.92 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  43.15 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  46.21 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4678  acetyl-CoA acetyltransferase  43.83 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4764  acetyl-CoA acetyltransferase  43.83 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1507  acetyl-CoA acetyltransferase  44.7 
 
 		 387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3971  acetyl-CoA acetyltransferase  43.43 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  43.94 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5063  acetyl-CoA acetyltransferase  43.58 
 
 		 387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287049  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  43.29 
 
 		 386 aa  303  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>