More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0253 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
380 aa  766    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  87.11 
 
 
380 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  78.85 
 
 
382 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  75.59 
 
 
381 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  73.23 
 
 
381 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  68.23 
 
 
384 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  66.93 
 
 
383 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 
383 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  65.01 
 
 
383 aa  495  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  64.06 
 
 
385 aa  478  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  62.89 
 
 
377 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  62.92 
 
 
382 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  60.62 
 
 
390 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  61.84 
 
 
377 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  59.74 
 
 
386 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  59.74 
 
 
386 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  61.34 
 
 
386 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  62.53 
 
 
387 aa  463  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  59.74 
 
 
386 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  61.88 
 
 
385 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  61.1 
 
 
383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  57.7 
 
 
389 aa  448  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  59.47 
 
 
387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  58.75 
 
 
382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  60.42 
 
 
382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  56.85 
 
 
394 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  55.99 
 
 
384 aa  421  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  56.63 
 
 
392 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  54.1 
 
 
390 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  55.78 
 
 
389 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  54.1 
 
 
390 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
392 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  58.81 
 
 
391 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  57.99 
 
 
385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  54.12 
 
 
385 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  53.45 
 
 
391 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.12 
 
 
385 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  54.12 
 
 
385 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  54.71 
 
 
390 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
391 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  57.99 
 
 
390 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 
385 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 
391 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  55.9 
 
 
389 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
392 aa  391  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  56.7 
 
 
385 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  53.12 
 
 
381 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
397 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  52.84 
 
 
385 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  54.83 
 
 
387 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  53.89 
 
 
386 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.42 
 
 
395 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  55.08 
 
 
391 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  53.33 
 
 
390 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  55.73 
 
 
390 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  53.2 
 
 
394 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  52.53 
 
 
399 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 
392 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.99 
 
 
397 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  52.32 
 
 
390 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.22 
 
 
394 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.83 
 
 
379 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  54.22 
 
 
394 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  53.23 
 
 
383 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  53.96 
 
 
394 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 
393 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.23 
 
 
383 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  53.23 
 
 
383 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  51.24 
 
 
397 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  52.99 
 
 
381 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  50.89 
 
 
397 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.38 
 
 
423 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  51.04 
 
 
379 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 
392 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  51.49 
 
 
397 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  51.96 
 
 
385 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.12 
 
 
392 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  51.28 
 
 
392 aa  363  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  52.71 
 
 
383 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
382 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  52.77 
 
 
373 aa  358  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  52.24 
 
 
392 aa  358  8e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  50.88 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
380 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
393 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
390 aa  345  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 
384 aa  339  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  47.59 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
393 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  47.87 
 
 
395 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  45.86 
 
 
395 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3409  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 
401 aa  311  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  45.17 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  44.01 
 
 
402 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  44.12 
 
 
403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  45.57 
 
 
387 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2352  thiolase  44.47 
 
 
395 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422281  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4631  acetyl-CoA acetyltransferase  44.23 
 
 
409 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  45.34 
 
 
399 aa  296  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>