More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3158 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
389 aa  791    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  75.64 
 
 
390 aa  572  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  72.09 
 
 
391 aa  553  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  64.72 
 
 
394 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  64.45 
 
 
391 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  65.64 
 
 
390 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  64.54 
 
 
392 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 
392 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  63.17 
 
 
391 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  63.43 
 
 
391 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  62.31 
 
 
390 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 
392 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  63.33 
 
 
390 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 
392 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  57.33 
 
 
381 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  56.41 
 
 
381 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  57.07 
 
 
380 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  57.03 
 
 
382 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  55.78 
 
 
380 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  54.96 
 
 
384 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  53.2 
 
 
386 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 
383 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.48 
 
 
383 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  53.61 
 
 
390 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  53.69 
 
 
382 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.85 
 
 
397 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
383 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  53.71 
 
 
387 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 
389 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  51.86 
 
 
397 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  51.36 
 
 
397 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
377 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  52.06 
 
 
386 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
377 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
382 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  51.8 
 
 
385 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
382 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
385 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.5 
 
 
423 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
391 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
383 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
381 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 
390 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  48.85 
 
 
385 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.85 
 
 
385 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 
392 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  48.85 
 
 
385 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
385 aa  365  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  51.43 
 
 
387 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
385 aa  363  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
387 aa  362  6e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 
390 aa  361  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 
385 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 
392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  47.86 
 
 
384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  47.57 
 
 
385 aa  356  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  50 
 
 
392 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  48.39 
 
 
392 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  48.22 
 
 
389 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  49.09 
 
 
379 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  48.36 
 
 
393 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  47.36 
 
 
397 aa  344  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.77 
 
 
392 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 
380 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  48.97 
 
 
381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  48.51 
 
 
392 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  46.87 
 
 
394 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  49.08 
 
 
373 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.75 
 
 
395 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  47.29 
 
 
383 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.68 
 
 
383 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  47.68 
 
 
383 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  47.03 
 
 
399 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  46.4 
 
 
395 aa  332  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  47.68 
 
 
383 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.62 
 
 
394 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  47.62 
 
 
394 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  47.37 
 
 
394 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 
393 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  44.76 
 
 
382 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  45.6 
 
 
393 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  47.58 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  45.88 
 
 
385 aa  316  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  44.76 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
384 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  45.2 
 
 
395 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  41.92 
 
 
387 aa  288  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  42.17 
 
 
403 aa  288  8e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2801  acetyl-CoA acetyltransferase  42.2 
 
 
383 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  41.5 
 
 
402 aa  285  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2740  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456276  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.04 
 
 
405 aa  282  7.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4631  acetyl-CoA acetyltransferase  40.86 
 
 
409 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2591  acetyl-CoA acetyltransferase  41.26 
 
 
401 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>