More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3993 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
385 aa  785    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  71.73 
 
 
386 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  71.73 
 
 
386 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  71.73 
 
 
386 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  71.35 
 
 
386 aa  565  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  69.27 
 
 
390 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  70.94 
 
 
384 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  69.74 
 
 
382 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  68.65 
 
 
387 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  69.82 
 
 
383 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  68.24 
 
 
383 aa  534  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  67.11 
 
 
382 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  67.54 
 
 
383 aa  532  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  67.27 
 
 
387 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  66.49 
 
 
385 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  66.67 
 
 
383 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  63.25 
 
 
381 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  63.52 
 
 
382 aa  498  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  63.52 
 
 
377 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  63.25 
 
 
384 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  64.06 
 
 
380 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  63.52 
 
 
377 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  62.73 
 
 
382 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  60.1 
 
 
381 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 
380 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  60.42 
 
 
389 aa  474  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  55.16 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  55.08 
 
 
392 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
392 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  52.41 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
391 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
391 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  53.61 
 
 
385 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  53.55 
 
 
391 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
391 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  51.8 
 
 
389 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 
391 aa  388  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  53.54 
 
 
392 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 
390 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
390 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.37 
 
 
397 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 
393 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.62 
 
 
423 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 
385 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  51.81 
 
 
381 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
390 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  50.74 
 
 
397 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  49.36 
 
 
385 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
389 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  51.94 
 
 
386 aa  368  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  48.51 
 
 
392 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  50.78 
 
 
379 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.52 
 
 
395 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.36 
 
 
385 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  49.36 
 
 
385 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
387 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
385 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
379 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
392 aa  363  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  49.13 
 
 
397 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  48.59 
 
 
385 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 
397 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  51.14 
 
 
390 aa  359  5e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  48.74 
 
 
397 aa  356  5e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  48.48 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
390 aa  355  6.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  50 
 
 
381 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  48.1 
 
 
392 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  49.22 
 
 
383 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.96 
 
 
383 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  48.96 
 
 
383 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
380 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  48.71 
 
 
385 aa  347  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.73 
 
 
392 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  48.99 
 
 
392 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.62 
 
 
394 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  49.62 
 
 
394 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  47.76 
 
 
399 aa  345  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  50.93 
 
 
373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  49.11 
 
 
394 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 
382 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 
390 aa  335  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  45.32 
 
 
393 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  44.7 
 
 
393 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  44.13 
 
 
384 aa  316  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  44.11 
 
 
394 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  43.11 
 
 
395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
400 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.91 
 
 
405 aa  299  6e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  44.81 
 
 
387 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.35 
 
 
412 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3971  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
387 aa  292  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1507  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 
387 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  42.37 
 
 
403 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  42.22 
 
 
409 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3495  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 
386 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>