More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0597 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  100 
 
 
394 aa  790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  63.47 
 
 
395 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  53.87 
 
 
383 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 
387 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 
382 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 
386 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
385 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
385 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.23 
 
 
385 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 
391 aa  382  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  49.23 
 
 
385 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  48.97 
 
 
385 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  51.55 
 
 
383 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.55 
 
 
383 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  51.55 
 
 
383 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  52.84 
 
 
397 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 
389 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  52.32 
 
 
379 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  49.36 
 
 
385 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
381 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 
385 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.84 
 
 
423 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
379 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
381 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
385 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  48.76 
 
 
394 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
382 aa  359  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  50.77 
 
 
381 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  51.63 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  51.8 
 
 
390 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 
390 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  50.79 
 
 
373 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
392 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 
383 aa  352  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  50.74 
 
 
392 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  47.36 
 
 
389 aa  351  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  48.22 
 
 
381 aa  349  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.51 
 
 
392 aa  349  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  47.55 
 
 
384 aa  349  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  48.87 
 
 
387 aa  349  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  48.4 
 
 
399 aa  349  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.75 
 
 
394 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  49.75 
 
 
394 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48 
 
 
395 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  47.24 
 
 
390 aa  345  5e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  48.76 
 
 
392 aa  346  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  49.75 
 
 
394 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
382 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.39 
 
 
397 aa  344  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  49.13 
 
 
392 aa  344  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  48.01 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  47.59 
 
 
380 aa  343  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 
397 aa  342  5e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.11 
 
 
383 aa  342  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  46.98 
 
 
385 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  47.1 
 
 
383 aa  338  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  47.74 
 
 
390 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  47.25 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  46.56 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
377 aa  334  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  47.1 
 
 
384 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
377 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.41 
 
 
399 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 
402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  43.65 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  46.35 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.28 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  45.18 
 
 
392 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.6 
 
 
400 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.03 
 
 
398 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  46.97 
 
 
383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  46.1 
 
 
390 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  43.83 
 
 
384 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  44.27 
 
 
393 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  44.92 
 
 
392 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
391 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 
398 aa  322  9.000000000000001e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 
407 aa  321  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  43.83 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
386 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
386 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
386 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  44.76 
 
 
389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  44.28 
 
 
387 aa  319  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.63 
 
 
414 aa  319  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  43.04 
 
 
390 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.61 
 
 
404 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  48.2 
 
 
386 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  43.15 
 
 
392 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 
400 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  44.44 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  42.13 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0061  acetyl-CoA acetyltransferase  45.17 
 
 
500 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>