More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5156 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  81.89 
 
 		 392 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  100 
 
 		 392 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  73.47 
 
 		 392 aa  598  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  72.96 
 
 		 392 aa  597  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  71.17 
 
 		 392 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  67.42 
 
 		 423 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  67.18 
 
 		 393 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  63.94 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.71 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  59.45 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  58.69 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.47 
 
 		 395 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 		 397 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 		 392 aa  431  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  55.1 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.38 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  53.9 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  56.38 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  56.12 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  53.9 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  52.27 
 
 		 385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.27 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  52.27 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  52.27 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  51 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  52.81 
 
 		 381 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  51.26 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  52.99 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 387 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  52.9 
 
 		 385 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  51.01 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  51.02 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.76 
 
 		 383 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  50.76 
 
 		 383 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 381 aa  381  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  49.25 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  48.87 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  51 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  51.12 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  48.49 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  49.12 
 
 		 380 aa  364  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  48.39 
 
 		 384 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 		 389 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  48.64 
 
 		 391 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  48.38 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  48.64 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 		 390 aa  358  7e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  49.02 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  47.54 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  48.39 
 
 		 390 aa  355  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  47.86 
 
 		 380 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  49 
 
 		 385 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  49.26 
 
 		 392 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  49.35 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  47 
 
 		 386 aa  349  6e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  46.73 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.5 
 
 		 383 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  46.65 
 
 		 391 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  47.75 
 
 		 383 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  47.78 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 		 377 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  50.53 
 
 		 392 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  48.51 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  46.77 
 
 		 389 aa  343  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  47.21 
 
 		 377 aa  342  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  47 
 
 		 384 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  46.46 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  46.5 
 
 		 387 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  46.1 
 
 		 386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  46.1 
 
 		 386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  46.1 
 
 		 386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  47.39 
 
 		 390 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  46.25 
 
 		 382 aa  338  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  47.5 
 
 		 383 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  46.48 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 		 382 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  44.08 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  46.73 
 
 		 384 aa  325  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  44.75 
 
 		 382 aa  322  9.000000000000001e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  48.25 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  43.64 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  45.91 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  44.06 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  41.91 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4928  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.5477 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3851  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  42.54 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 401 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8201  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45 
 
 		 385 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3569  acetyl-CoA acetyltransferase  41.46 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>