More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2545 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
385 aa  768    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  88.31 
 
 
385 aa  676    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  69.41 
 
 
390 aa  548  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  61.13 
 
 
391 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  58.82 
 
 
381 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  58.82 
 
 
387 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.19 
 
 
395 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  57.18 
 
 
382 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  58.96 
 
 
397 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  57.62 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.36 
 
 
397 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  55.86 
 
 
397 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  58.78 
 
 
393 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  56.3 
 
 
381 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  56.31 
 
 
394 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  57.99 
 
 
380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  55.81 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  55.96 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.9 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  54.91 
 
 
392 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  55.25 
 
 
399 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  55.92 
 
 
423 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
383 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  52.78 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  56.07 
 
 
377 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  57.04 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  55.93 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  57.36 
 
 
377 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  54.68 
 
 
397 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  54.23 
 
 
397 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 
382 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  54.29 
 
 
379 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.46 
 
 
394 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  55.9 
 
 
390 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  56.46 
 
 
394 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  56.2 
 
 
394 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  55.01 
 
 
380 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  53.55 
 
 
384 aa  388  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  54.31 
 
 
387 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  53.9 
 
 
392 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  54.45 
 
 
392 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  53.61 
 
 
385 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  54.22 
 
 
386 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  53.98 
 
 
390 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.45 
 
 
383 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  52.53 
 
 
392 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 
392 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  51.16 
 
 
385 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
382 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
382 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  53.12 
 
 
381 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.16 
 
 
385 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  52.32 
 
 
386 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  52.32 
 
 
386 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  51.16 
 
 
385 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  52.32 
 
 
386 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  54.43 
 
 
379 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 
393 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
391 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 
390 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
383 aa  378  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  50.9 
 
 
385 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  51.51 
 
 
394 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 
390 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  52.71 
 
 
383 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  55.9 
 
 
390 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 
391 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  53.08 
 
 
389 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.71 
 
 
383 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
393 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  52.71 
 
 
383 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  53.2 
 
 
382 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 
385 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  54.85 
 
 
391 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
385 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
389 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  51.9 
 
 
392 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  52.07 
 
 
387 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
385 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
391 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  51.95 
 
 
381 aa  363  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  52.04 
 
 
394 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 
389 aa  360  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
390 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  47.33 
 
 
384 aa  348  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  52.13 
 
 
373 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
383 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  48.89 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 
395 aa  336  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  47.26 
 
 
398 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 
384 aa  334  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  47.26 
 
 
398 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3495  acetyl-CoA acetyltransferase  48.22 
 
 
386 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  49.39 
 
 
400 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  48.73 
 
 
386 aa  328  8e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  48.05 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10876  acetyl-CoA acetyltransferase  47.91 
 
 
412 aa  326  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0134606  normal  0.123621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>