More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4557 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
387 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  67.54 
 
 
383 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  67.54 
 
 
383 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  67.54 
 
 
383 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  67.11 
 
 
381 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  65.89 
 
 
386 aa  508  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  66.4 
 
 
381 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  65.18 
 
 
385 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  66.58 
 
 
373 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  62.5 
 
 
385 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.24 
 
 
385 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  62.24 
 
 
385 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  63.68 
 
 
379 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  61.72 
 
 
385 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  66.32 
 
 
390 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  64.1 
 
 
390 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  61.2 
 
 
385 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
389 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  65.9 
 
 
390 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  59.85 
 
 
391 aa  436  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  56.71 
 
 
397 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  56.46 
 
 
397 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  56.54 
 
 
381 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  55.13 
 
 
392 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.94 
 
 
397 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.23 
 
 
395 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  55.81 
 
 
394 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  55.96 
 
 
392 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  55.61 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  54.22 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.57 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  55.79 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  55.73 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  53.59 
 
 
392 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  53.89 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.82 
 
 
394 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  54.81 
 
 
384 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  56.82 
 
 
394 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  54.71 
 
 
381 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  56.57 
 
 
394 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  54.43 
 
 
399 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.02 
 
 
392 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  54.83 
 
 
385 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  54.83 
 
 
380 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  53.37 
 
 
393 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  54.24 
 
 
392 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  54.31 
 
 
385 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  53.79 
 
 
382 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
391 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  53 
 
 
380 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 
394 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.17 
 
 
383 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
382 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
391 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  53.09 
 
 
394 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
391 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  51.14 
 
 
397 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
390 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
392 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
390 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
392 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  53.89 
 
 
383 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  53.39 
 
 
380 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  53.13 
 
 
392 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 
390 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  51.56 
 
 
383 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  51.44 
 
 
383 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 
377 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
390 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  52.08 
 
 
387 aa  364  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  51.43 
 
 
389 aa  363  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  53.93 
 
 
377 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
395 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  49.22 
 
 
386 aa  360  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
386 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
386 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
386 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  52.47 
 
 
391 aa  358  8e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  49.22 
 
 
384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
385 aa  356  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
383 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
382 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
385 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
382 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  48.7 
 
 
389 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
387 aa  352  7e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  49.22 
 
 
393 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  46.88 
 
 
384 aa  346  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  52.08 
 
 
395 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  51.3 
 
 
382 aa  344  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 
407 aa  342  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  48.38 
 
 
402 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 
390 aa  339  4e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3409  acetyl-CoA acetyltransferase  47.29 
 
 
401 aa  335  5e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  45.61 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.96 
 
 
385 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  46.74 
 
 
392 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2352  thiolase  46.8 
 
 
395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422281  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  43.25 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>