More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2360 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 
385 aa  765    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2352  thiolase  60.67 
 
 
395 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422281  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  60.36 
 
 
384 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0409  acetyl-CoA acetyltransferase  62.21 
 
 
399 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
379 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  55.35 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  55.41 
 
 
380 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  51.81 
 
 
382 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  53.06 
 
 
391 aa  351  1e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
397 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.13 
 
 
397 aa  343  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  49.12 
 
 
397 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
385 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  48.14 
 
 
392 aa  328  9e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  48.24 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  48.74 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  48.39 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
390 aa  325  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  47.42 
 
 
407 aa  325  8.000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  48.37 
 
 
397 aa  322  7e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  48.96 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  48.24 
 
 
392 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 
381 aa  319  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.85 
 
 
395 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
386 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3409  acetyl-CoA acetyltransferase  46.08 
 
 
401 aa  316  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.22 
 
 
423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  46.46 
 
 
394 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  47.61 
 
 
392 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  44.44 
 
 
385 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.44 
 
 
385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  44.44 
 
 
385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.1 
 
 
383 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  44.62 
 
 
393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.16 
 
 
392 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  44.44 
 
 
385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  47.18 
 
 
386 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  47.18 
 
 
386 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  47.18 
 
 
386 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  46.1 
 
 
390 aa  302  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 
390 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  46.53 
 
 
383 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 
382 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.53 
 
 
383 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  46.53 
 
 
383 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  45.82 
 
 
382 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  46.33 
 
 
386 aa  299  5e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  45.39 
 
 
399 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  46.46 
 
 
394 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  43.41 
 
 
385 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.21 
 
 
394 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  46.21 
 
 
394 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  43.46 
 
 
402 aa  296  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
380 aa  297  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  46.82 
 
 
380 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  47.03 
 
 
394 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8201  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.42 
 
 
385 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  43.59 
 
 
393 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3495  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 
386 aa  292  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  44.44 
 
 
381 aa  292  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3654  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
387 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  44.05 
 
 
383 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  43.94 
 
 
389 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  45.05 
 
 
381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
384 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  44.61 
 
 
394 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3971  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
387 aa  285  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  44.13 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  46.42 
 
 
373 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  43.36 
 
 
395 aa  282  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  44.16 
 
 
385 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  43.19 
 
 
385 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4678  acetyl-CoA acetyltransferase  44.13 
 
 
387 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4764  acetyl-CoA acetyltransferase  44.13 
 
 
387 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127156  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  44.99 
 
 
377 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13579  acetyl-CoA acetyltransferase  45.75 
 
 
391 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0692846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2812  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 
387 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000975641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
383 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  43.26 
 
 
389 aa  280  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
386 aa  279  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  43.24 
 
 
403 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5063  acetyl-CoA acetyltransferase  43.88 
 
 
387 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287049  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1507  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 
387 aa  279  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0542  acetyl-CoA acetyltransferases  41.73 
 
 
401 aa  279  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0376899  normal  0.0679455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0872  acetyl-CoA acetyltransferase  43.24 
 
 
403 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0901574  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2295  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
403 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577319  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  45.13 
 
 
390 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  44.05 
 
 
392 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  44.73 
 
 
377 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  44.44 
 
 
396 aa  276  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  44.3 
 
 
392 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  42.53 
 
 
398 aa  275  9e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  41.48 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  40.97 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>