More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1278 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  100 
 
 		 397 aa  809    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  66.75 
 
 		 392 aa  534  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  66.49 
 
 		 392 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  66.07 
 
 		 393 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  66.49 
 
 		 392 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  64.71 
 
 		 392 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.94 
 
 		 392 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  63.78 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.53 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  61.77 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  58.48 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  60.56 
 
 		 392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.85 
 
 		 395 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  58.31 
 
 		 394 aa  454  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  57.47 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  55.45 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.78 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  56.53 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  56.78 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  54.5 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  54.82 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  54.22 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  54.5 
 
 		 381 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  55.93 
 
 		 379 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  54.14 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  54.68 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  54.57 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  53.83 
 
 		 383 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 		 385 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.83 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  53.22 
 
 		 391 aa  393  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  53.83 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  54.16 
 
 		 389 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  52.03 
 
 		 385 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.03 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  52.03 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  52.91 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  52.76 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  51.27 
 
 		 385 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  53.63 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 		 381 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  53.33 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  51.77 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  52.84 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 		 386 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  47.52 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  49.12 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 		 386 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 		 386 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 		 386 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  47.89 
 
 		 392 aa  358  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  52.38 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 385 aa  356  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50 
 
 		 383 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  47.76 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  48.02 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  47.87 
 
 		 383 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 		 385 aa  352  8e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  51.33 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  49.75 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  47.24 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  47.36 
 
 		 389 aa  344  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  48.5 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  45.48 
 
 		 384 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  45.64 
 
 		 391 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  47.87 
 
 		 382 aa  342  7e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  45.39 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 		 391 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  45.71 
 
 		 382 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 		 390 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  48.13 
 
 		 392 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  48.87 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  46.48 
 
 		 393 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  45.91 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  46.72 
 
 		 384 aa  329  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  45.89 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  44.28 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  46.08 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  47.75 
 
 		 395 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5510  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.94 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  47.99 
 
 		 390 aa  312  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.37 
 
 		 385 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4631  acetyl-CoA acetyltransferase  45.61 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0242  acetyl-CoA acetyltransferase  44.8 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2349  acetyl-CoA acetyltransferase  44.93 
 
 		 415 aa  308  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  43.98 
 
 		 402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>