More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3611 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  90.28 
 
 		 391 aa  739    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  94.37 
 
 		 391 aa  765    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  84.14 
 
 		 390 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  87.47 
 
 		 390 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 391 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  76.47 
 
 		 390 aa  628  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  77.1 
 
 		 392 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  76.08 
 
 		 392 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  72.91 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  75.57 
 
 		 392 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  72.77 
 
 		 392 aa  566  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  63.43 
 
 		 389 aa  511  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  67.01 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  65.31 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  53.79 
 
 		 384 aa  421  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.86 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 		 380 aa  408  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.4 
 
 		 383 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  51.12 
 
 		 397 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  53.45 
 
 		 380 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  52.25 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 		 381 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  50.63 
 
 		 391 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.13 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  50.13 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  50.13 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 		 382 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 386 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 386 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 377 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 386 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 377 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  49.62 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 385 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  49.26 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  47.89 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  48.87 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  48.48 
 
 		 387 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.75 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  49.63 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  47.98 
 
 		 389 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  50.9 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  46.82 
 
 		 384 aa  363  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.1 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  49.1 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.8 
 
 		 394 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  50.8 
 
 		 394 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.64 
 
 		 392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  50.53 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  48.85 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.13 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  48.49 
 
 		 393 aa  358  8e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 		 392 aa  358  8e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  47.78 
 
 		 399 aa  358  9e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  50.12 
 
 		 392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  47.68 
 
 		 383 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  49.75 
 
 		 392 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  49.38 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 380 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 		 379 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  46.56 
 
 		 382 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  48.28 
 
 		 373 aa  349  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  45.38 
 
 		 393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  44.64 
 
 		 397 aa  338  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  45.13 
 
 		 393 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 		 384 aa  329  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  43.93 
 
 		 385 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  42.89 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  44.44 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 		 387 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2801  acetyl-CoA acetyltransferase  40.41 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  41.9 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2613  acetyl-CoA acetyltransferase  41.81 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  42.78 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2352  thiolase  41.98 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422281  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3654  acetyl-CoA acetyltransferase  42.17 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>