More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2613 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2613  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
387 aa  772    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2812  acetyl-CoA acetyltransferase  89.66 
 
 
387 aa  701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000975641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5063  acetyl-CoA acetyltransferase  69.77 
 
 
387 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287049  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4678  acetyl-CoA acetyltransferase  69.77 
 
 
387 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4764  acetyl-CoA acetyltransferase  69.77 
 
 
387 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127156  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1507  acetyl-CoA acetyltransferase  69.51 
 
 
387 aa  542  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5259  acetyl-CoA acetyltransferase  70.03 
 
 
387 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  67.44 
 
 
386 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3971  acetyl-CoA acetyltransferase  67.7 
 
 
387 aa  529  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487297  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13579  acetyl-CoA acetyltransferase  68.29 
 
 
391 aa  525  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0692846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2740  acetyl-CoA acetyltransferase  65.98 
 
 
388 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3654  acetyl-CoA acetyltransferase  67.7 
 
 
387 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8201  Acetyl-CoA C-acyltransferase  66.67 
 
 
385 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3495  acetyl-CoA acetyltransferase  64.08 
 
 
386 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  60.72 
 
 
387 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2801  acetyl-CoA acetyltransferase  56.04 
 
 
383 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  47.24 
 
 
390 aa  328  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  47.98 
 
 
391 aa  315  7e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  47.93 
 
 
380 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  47.15 
 
 
379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  46.73 
 
 
385 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  47.14 
 
 
383 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  46.84 
 
 
385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  44.94 
 
 
382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 
397 aa  306  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  44.91 
 
 
392 aa  302  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  43.77 
 
 
390 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  43.69 
 
 
386 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  43.69 
 
 
386 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  43.69 
 
 
386 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  43.69 
 
 
392 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  45.04 
 
 
392 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  45.1 
 
 
386 aa  299  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  43.43 
 
 
381 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  43.97 
 
 
382 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.78 
 
 
385 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  44.78 
 
 
385 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  45.75 
 
 
393 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  42.07 
 
 
391 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  41.25 
 
 
390 aa  295  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  45.29 
 
 
385 aa  295  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
392 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
392 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
390 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  44.53 
 
 
385 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  44.89 
 
 
384 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.22 
 
 
395 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 
394 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  41.81 
 
 
391 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  42.71 
 
 
382 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  44.08 
 
 
387 aa  293  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  44.27 
 
 
385 aa  292  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  42.46 
 
 
386 aa  292  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  47.8 
 
 
394 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  44.11 
 
 
381 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  45.16 
 
 
397 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 
382 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.41 
 
 
397 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  44.75 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 
392 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.94 
 
 
423 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  45.02 
 
 
392 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
383 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
383 aa  286  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.69 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  42.07 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.47 
 
 
383 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
389 aa  282  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  43.26 
 
 
377 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  40.55 
 
 
391 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  41.94 
 
 
377 aa  279  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  42.82 
 
 
392 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  41.46 
 
 
399 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  43.77 
 
 
379 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  45.88 
 
 
394 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
397 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
391 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  41.58 
 
 
383 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  42.17 
 
 
380 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  41.96 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.87 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  44.87 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  44.87 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  43.83 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  41.22 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  43.41 
 
 
399 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 
389 aa  272  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  40.55 
 
 
389 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  40.6 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  44.19 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  44.87 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.92 
 
 
385 aa  269  8e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.87 
 
 
394 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  44.87 
 
 
394 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  43.53 
 
 
390 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  40.93 
 
 
403 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  40.34 
 
 
398 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  44.74 
 
 
373 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>