More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1960 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
397 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  78.59 
 
 
397 aa  641    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  73.8 
 
 
397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  69.1 
 
 
392 aa  542  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  65.9 
 
 
393 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  61.21 
 
 
392 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.63 
 
 
395 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.45 
 
 
392 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 
397 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  61.77 
 
 
397 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  59.45 
 
 
392 aa  478  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  60.86 
 
 
394 aa  478  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  58.94 
 
 
392 aa  477  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  58.44 
 
 
392 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.69 
 
 
423 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  59.6 
 
 
399 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.1 
 
 
394 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  60.1 
 
 
394 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  59.85 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  57.71 
 
 
391 aa  429  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  55.92 
 
 
381 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  54.77 
 
 
395 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  56.46 
 
 
387 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  55.89 
 
 
386 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.27 
 
 
385 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  54.27 
 
 
385 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  56.68 
 
 
379 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  54.27 
 
 
385 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  55.86 
 
 
385 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  56.36 
 
 
385 aa  408  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  53.77 
 
 
385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  51.12 
 
 
391 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  53.27 
 
 
379 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  51.12 
 
 
391 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  53.27 
 
 
385 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
390 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  50.87 
 
 
391 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  51.86 
 
 
389 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  53.69 
 
 
390 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  52.36 
 
 
389 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  52.64 
 
 
380 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  52.1 
 
 
392 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  50.87 
 
 
390 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 
390 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  53.42 
 
 
381 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  52 
 
 
383 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  50.86 
 
 
394 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52 
 
 
383 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  52 
 
 
383 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 
389 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  50.62 
 
 
390 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  50.62 
 
 
392 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  53.2 
 
 
390 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  51.73 
 
 
382 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  50.62 
 
 
392 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  52.11 
 
 
381 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  53.12 
 
 
390 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  51.86 
 
 
381 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  51.49 
 
 
380 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
384 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 
386 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 
386 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 
386 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 
383 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  53.11 
 
 
373 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  48.51 
 
 
390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  48.64 
 
 
386 aa  362  9e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  50.5 
 
 
380 aa  362  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 
385 aa  353  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  49.13 
 
 
385 aa  352  5e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
377 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  47.16 
 
 
382 aa  351  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.89 
 
 
383 aa  349  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 
391 aa  346  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
390 aa  345  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  46.35 
 
 
382 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 
393 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  48.64 
 
 
387 aa  342  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  46.32 
 
 
402 aa  341  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  46.72 
 
 
383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  49 
 
 
377 aa  339  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  48.89 
 
 
385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  48.01 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  47.41 
 
 
383 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.13 
 
 
385 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  47.16 
 
 
382 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  47.49 
 
 
393 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2352  thiolase  46.4 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422281  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  44.69 
 
 
384 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  46.42 
 
 
382 aa  324  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 
383 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
384 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  45.79 
 
 
387 aa  319  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3851  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
401 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4928  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
401 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.5477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3569  acetyl-CoA acetyltransferase  44.9 
 
 
401 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42090  acetyl-CoA acetyltransferase  44.9 
 
 
401 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  45.78 
 
 
402 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.75 
 
 
387 aa  314  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>