More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2740 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2740  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
388 aa  777    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456276  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  68.81 
 
 
386 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1507  acetyl-CoA acetyltransferase  65.72 
 
 
387 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5259  acetyl-CoA acetyltransferase  64.43 
 
 
387 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4678  acetyl-CoA acetyltransferase  64.18 
 
 
387 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557214  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13579  acetyl-CoA acetyltransferase  65.56 
 
 
391 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0692846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4764  acetyl-CoA acetyltransferase  64.18 
 
 
387 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127156  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5063  acetyl-CoA acetyltransferase  63.92 
 
 
387 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287049  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2812  acetyl-CoA acetyltransferase  64.95 
 
 
387 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000975641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2613  acetyl-CoA acetyltransferase  65.98 
 
 
387 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3654  acetyl-CoA acetyltransferase  66.49 
 
 
387 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3971  acetyl-CoA acetyltransferase  63.66 
 
 
387 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487297  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3495  acetyl-CoA acetyltransferase  63.14 
 
 
386 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8201  Acetyl-CoA C-acyltransferase  64.68 
 
 
385 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  61.6 
 
 
387 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2801  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
383 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  47.22 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
383 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  45.11 
 
 
390 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  46.21 
 
 
385 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
382 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 
379 aa  309  5e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  45.23 
 
 
383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  46.91 
 
 
380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  44.84 
 
 
381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  45.48 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.86 
 
 
383 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
382 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  44.84 
 
 
392 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.02 
 
 
395 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 
384 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  43.56 
 
 
392 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  43.72 
 
 
382 aa  298  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  45.48 
 
 
394 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  45.36 
 
 
383 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  44.87 
 
 
381 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  43.24 
 
 
392 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  42.08 
 
 
397 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  44.89 
 
 
394 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 
377 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  43.83 
 
 
392 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  43.51 
 
 
385 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  43.51 
 
 
385 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  43.22 
 
 
382 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  43.26 
 
 
385 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  44.9 
 
 
377 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  41.31 
 
 
390 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
392 aa  286  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  43.07 
 
 
394 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  41.29 
 
 
389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  42.36 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  40.55 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 
385 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  42.49 
 
 
385 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 
380 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  41.35 
 
 
385 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  43.49 
 
 
399 aa  278  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  43.72 
 
 
390 aa  278  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 
380 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  44.82 
 
 
379 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  42.4 
 
 
397 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
392 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  40.3 
 
 
390 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  43.1 
 
 
397 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  42.79 
 
 
394 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  39.7 
 
 
391 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.79 
 
 
394 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  42.79 
 
 
394 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  40.2 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  39.95 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  40.91 
 
 
386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  40.91 
 
 
386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  40.91 
 
 
386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  39.2 
 
 
391 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  39.7 
 
 
382 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  42.79 
 
 
423 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
389 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  42.14 
 
 
397 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  40.7 
 
 
383 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  41.77 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.15 
 
 
392 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  40.88 
 
 
400 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.75 
 
 
397 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  39.45 
 
 
386 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  39.13 
 
 
384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  39.65 
 
 
384 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  42.27 
 
 
387 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  40.98 
 
 
385 aa  262  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  40.74 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  40.32 
 
 
392 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  42.11 
 
 
390 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  41.25 
 
 
385 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3409  acetyl-CoA acetyltransferase  41.13 
 
 
401 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1186  acetyl-CoA acetyltransferase  39.66 
 
 
402 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  41.73 
 
 
385 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>