More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0085 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
391 aa  769    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 
386 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  61.13 
 
 
385 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  59.03 
 
 
390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 
385 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  60.45 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  59.08 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.71 
 
 
397 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  59.85 
 
 
387 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  61.06 
 
 
393 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  58.46 
 
 
381 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  56.15 
 
 
385 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  58.46 
 
 
397 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.9 
 
 
385 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.6 
 
 
395 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  55.9 
 
 
385 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  57.71 
 
 
397 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  58.96 
 
 
394 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  58.48 
 
 
399 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 
381 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  56.3 
 
 
383 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  55.64 
 
 
385 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  54.87 
 
 
382 aa  424  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  57.8 
 
 
379 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  57.33 
 
 
379 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 
392 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.55 
 
 
394 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  59.55 
 
 
394 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  55.13 
 
 
385 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.97 
 
 
423 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  57.32 
 
 
389 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  59.31 
 
 
394 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  56.58 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 
392 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 
381 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  56.79 
 
 
392 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  57.43 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  53.42 
 
 
390 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  55.39 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  56.3 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  55.83 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  52.15 
 
 
391 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
391 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  54.94 
 
 
392 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  56.19 
 
 
392 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  55.41 
 
 
383 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.41 
 
 
383 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  55.41 
 
 
383 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  54.29 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  57.43 
 
 
390 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  50.63 
 
 
391 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.99 
 
 
392 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  55.16 
 
 
387 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  55.98 
 
 
377 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 
390 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  55.3 
 
 
384 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  53.22 
 
 
397 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  54.94 
 
 
392 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  56.38 
 
 
377 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  54.66 
 
 
380 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  55.08 
 
 
380 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  54.01 
 
 
385 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  53.87 
 
 
381 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  54.77 
 
 
382 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 
393 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.41 
 
 
383 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 
389 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  55.13 
 
 
390 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
391 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  54.55 
 
 
383 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
383 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 
385 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  52.15 
 
 
390 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  52.03 
 
 
394 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
389 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  52.14 
 
 
385 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
386 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
386 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 
386 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
382 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
386 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  51.27 
 
 
390 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
384 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
383 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  53.03 
 
 
390 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
384 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  53.35 
 
 
395 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 
387 aa  364  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  48.74 
 
 
382 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  52.36 
 
 
373 aa  352  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  46 
 
 
402 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 
392 aa  342  8e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.85 
 
 
387 aa  342  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.33 
 
 
387 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.06 
 
 
385 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  48.16 
 
 
407 aa  339  5.9999999999999996e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  48.54 
 
 
403 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
391 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>