More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3344 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
393 aa  800    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  85.97 
 
 
393 aa  689    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
391 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 
385 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 
390 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
385 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.63 
 
 
395 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
381 aa  359  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  46.97 
 
 
383 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  48.25 
 
 
397 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  48.62 
 
 
392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50 
 
 
397 aa  352  7e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.68 
 
 
385 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  47.68 
 
 
385 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  47.68 
 
 
385 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  49.22 
 
 
387 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  48.66 
 
 
399 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
381 aa  349  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  47.42 
 
 
385 aa  348  9e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 
392 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
380 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  44.84 
 
 
382 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  48.38 
 
 
394 aa  346  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.88 
 
 
394 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  48.88 
 
 
394 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  46.65 
 
 
385 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 
390 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
390 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 
397 aa  344  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
386 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  48.02 
 
 
392 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
380 aa  342  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  48.38 
 
 
394 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  46.95 
 
 
394 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  48.12 
 
 
392 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.91 
 
 
383 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  46.91 
 
 
383 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  46.91 
 
 
383 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  45.13 
 
 
391 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  45.38 
 
 
391 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  47.96 
 
 
387 aa  338  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  45.38 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  47.87 
 
 
393 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 
382 aa  335  7.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 
392 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 
380 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  48.73 
 
 
389 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
391 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  48.13 
 
 
392 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  47.33 
 
 
384 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  46.91 
 
 
381 aa  333  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
386 aa  332  6e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  47.94 
 
 
377 aa  332  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  48.25 
 
 
397 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  46.48 
 
 
397 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  45.55 
 
 
385 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  48.49 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.48 
 
 
423 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  46.63 
 
 
392 aa  327  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
383 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  47.94 
 
 
377 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
386 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
386 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
386 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  44.81 
 
 
389 aa  323  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  45.6 
 
 
389 aa  322  5e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  45.75 
 
 
392 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 
383 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 
390 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  44.22 
 
 
381 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  44.62 
 
 
390 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  44.27 
 
 
394 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.92 
 
 
383 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  46.82 
 
 
382 aa  315  6e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  44.07 
 
 
384 aa  314  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  46.98 
 
 
395 aa  313  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  45.32 
 
 
385 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43 
 
 
392 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
379 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  44.02 
 
 
390 aa  309  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
384 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  43.88 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  45.65 
 
 
373 aa  302  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  46.53 
 
 
390 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  43.94 
 
 
385 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
383 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  43.22 
 
 
392 aa  292  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  43.07 
 
 
402 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  43.72 
 
 
391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  40.29 
 
 
402 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  43.03 
 
 
402 aa  286  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  44.01 
 
 
391 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  41.12 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>