More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1000 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 392 aa  798    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 		 392 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  75.26 
 
 		 392 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  74.62 
 
 		 394 aa  601  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  72.96 
 
 		 390 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  72.52 
 
 		 391 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  72.77 
 
 		 391 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  73.28 
 
 		 391 aa  597  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  70.66 
 
 		 390 aa  589  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  73.21 
 
 		 392 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  73.21 
 
 		 390 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 		 391 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 		 389 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  65.39 
 
 		 390 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 		 381 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  53.9 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  55.1 
 
 		 380 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  54.94 
 
 		 391 aa  411  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  52.01 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  55.22 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  52.14 
 
 		 386 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  51.77 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  51.77 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  53.3 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  51.77 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 		 381 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  53.54 
 
 		 385 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.78 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  53.21 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  54.98 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  52.53 
 
 		 383 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.86 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.38 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  50.38 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  50.38 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  50.63 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  51.9 
 
 		 385 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 379 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  49.36 
 
 		 385 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.64 
 
 		 395 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  51.27 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.24 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  49.01 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  51.11 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.53 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  51.27 
 
 		 380 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  52.53 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  52.27 
 
 		 394 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.85 
 
 		 383 aa  356  5e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  48.85 
 
 		 383 aa  356  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 		 392 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  49.25 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  48.59 
 
 		 383 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 		 383 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  48.85 
 
 		 381 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  50.12 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  49.38 
 
 		 399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  51.11 
 
 		 392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.25 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 		 382 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 		 393 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 373 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  48.12 
 
 		 397 aa  345  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 379 aa  343  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 		 384 aa  342  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 390 aa  339  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 		 393 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2064  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 		 395 aa  333  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 		 385 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  43.94 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1897  acetyl-CoA acetyltransferase  45.14 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2801  acetyl-CoA acetyltransferase  42.68 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  41.97 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  43.64 
 
 		 390 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2352  thiolase  44.76 
 
 		 395 aa  288  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422281  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  43.46 
 
 		 400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  42.41 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>