More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3630 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
382 aa  777    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  76.49 
 
 
387 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3832  acetyl-CoA acetyltransferase  71.05 
 
 
387 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  72.06 
 
 
383 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  71.88 
 
 
384 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  70.5 
 
 
389 aa  547  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  70.23 
 
 
383 aa  541  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  70.23 
 
 
383 aa  537  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  67.11 
 
 
385 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  65.17 
 
 
386 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  65.17 
 
 
386 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  65.17 
 
 
386 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  64.51 
 
 
386 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  67.62 
 
 
377 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  67.1 
 
 
385 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  66.06 
 
 
383 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2608  acetyl-CoA acetyltransferase  66.06 
 
 
377 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  64.92 
 
 
382 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2161  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 
384 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.425304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  63.64 
 
 
390 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  63.19 
 
 
381 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  62.3 
 
 
382 aa  491  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  63.47 
 
 
382 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  61.88 
 
 
381 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  62.92 
 
 
380 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 
380 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 
385 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3611  acetyl-CoA acetyltransferase  52.78 
 
 
392 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
394 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
392 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  53.71 
 
 
385 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
390 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 
390 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
390 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 
392 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 
392 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3158  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
389 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.01 
 
 
395 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 
391 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
391 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
391 aa  373  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
392 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
391 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
390 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 
389 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  53.35 
 
 
391 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.37 
 
 
423 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.38 
 
 
392 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  52.26 
 
 
390 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  51.42 
 
 
386 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  49.25 
 
 
392 aa  359  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  49.11 
 
 
385 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
381 aa  359  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  49.37 
 
 
392 aa  358  6e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.11 
 
 
385 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  49.11 
 
 
385 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  48.73 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
387 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  48.62 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
385 aa  353  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  51.76 
 
 
390 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  48.35 
 
 
385 aa  348  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
383 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 
393 aa  346  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  47.41 
 
 
397 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
379 aa  345  7e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.75 
 
 
394 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  49.75 
 
 
394 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  47.33 
 
 
382 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  49.49 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  47.87 
 
 
397 aa  342  7e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1069  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
390 aa  342  7e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  48.48 
 
 
394 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
379 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  47.63 
 
 
392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  47.44 
 
 
383 aa  338  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.44 
 
 
383 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  47.44 
 
 
383 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
380 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.42 
 
 
397 aa  335  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 
393 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  47.16 
 
 
397 aa  333  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  48.19 
 
 
381 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  48.54 
 
 
373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  45.21 
 
 
397 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  46.33 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1568  acetyl-CoA acetyltransferase  44.84 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  44.75 
 
 
402 aa  302  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3971  acetyl-CoA acetyltransferase  43.07 
 
 
387 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  46 
 
 
400 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4678  acetyl-CoA acetyltransferase  43.22 
 
 
387 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4764  acetyl-CoA acetyltransferase  43.22 
 
 
387 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127156  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3569  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 
401 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42090  acetyl-CoA acetyltransferase  43.72 
 
 
401 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  43.75 
 
 
385 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  43.31 
 
 
403 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5063  acetyl-CoA acetyltransferase  42.96 
 
 
387 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287049  normal  0.843392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>