More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1677 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  99.49 
 
 		 391 aa  798    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.35 
 
 		 391 aa  766    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.61 
 
 		 391 aa  756    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  80.26 
 
 		 391 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.35 
 
 		 391 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  94.63 
 
 		 391 aa  768    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 		 391 aa  803    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.61 
 
 		 391 aa  756    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  92.84 
 
 		 391 aa  759    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  99.74 
 
 		 391 aa  801    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  99.74 
 
 		 391 aa  801    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.91 
 
 		 391 aa  588  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.54 
 
 		 391 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.52 
 
 		 391 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.27 
 
 		 387 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.01 
 
 		 387 aa  531  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.05 
 
 		 387 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.88 
 
 		 387 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.62 
 
 		 387 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.36 
 
 		 387 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.1 
 
 		 387 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.32 
 
 		 387 aa  529  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.99 
 
 		 387 aa  529  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.84 
 
 		 387 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.58 
 
 		 387 aa  522  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.84 
 
 		 387 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.84 
 
 		 387 aa  524  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.84 
 
 		 387 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.84 
 
 		 387 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.84 
 
 		 387 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.97 
 
 		 387 aa  524  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.94 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.19 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.13 
 
 		 390 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.32 
 
 		 387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.8 
 
 		 387 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.06 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.06 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.06 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.06 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.8 
 
 		 387 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  63.54 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  63.54 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.54 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.54 
 
 		 387 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.75 
 
 		 390 aa  511  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.54 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.95 
 
 		 386 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.8 
 
 		 387 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.54 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.54 
 
 		 387 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.28 
 
 		 387 aa  510  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  63.28 
 
 		 387 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.5 
 
 		 390 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.82 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.27 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.12 
 
 		 387 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.12 
 
 		 387 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.12 
 
 		 387 aa  502  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.6 
 
 		 386 aa  498  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2392  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.92 
 
 		 392 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  60.52 
 
 		 387 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.88 
 
 		 387 aa  488  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.54 
 
 		 374 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 		 398 aa  347  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.42 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  45.57 
 
 		 403 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  45.89 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 		 390 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.41 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  43.6 
 
 		 399 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  44.9 
 
 		 390 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  45.18 
 
 		 392 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  47.63 
 
 		 391 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.45 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  45.02 
 
 		 401 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  46.98 
 
 		 391 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  46.13 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  45.13 
 
 		 382 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  43.6 
 
 		 398 aa  311  9e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  44.75 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  45.34 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  45.85 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.81 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.64 
 
 		 402 aa  308  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  44.05 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.14 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  43.51 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  45.99 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.41 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.1 
 
 		 424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  43.84 
 
 		 402 aa  305  8.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.83 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.06 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  44.95 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.93 
 
 		 402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1653  acetyl-CoA acetyltransferase  44.06 
 
 		 402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302534  normal  0.125875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>