43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3607 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  86.65 
 
 		 504 aa  899    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 503 aa  1025    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  70.92 
 
 		 504 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  86.06 
 
 		 503 aa  900    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  59 
 
 		 494 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  43.29 
 
 		 498 aa  365  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  37.7 
 
 		 515 aa  267  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  35.88 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  35.79 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  35.79 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  34.56 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  35.58 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  34.31 
 
 		 494 aa  226  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  32.29 
 
 		 517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  31.46 
 
 		 506 aa  200  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  33.98 
 
 		 486 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  31.3 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  33.64 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  30.82 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  30.82 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  30.82 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  30.48 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  30.48 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  30.08 
 
 		 509 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  29.12 
 
 		 439 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  29.82 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  27.2 
 
 		 509 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 		 797 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  25.53 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0758  hypothetical protein  23.12 
 
 		 357 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  24.65 
 
 		 379 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  24.07 
 
 		 379 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  24.07 
 
 		 379 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  22.92 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  24.43 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  23.1 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  23.69 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  24.16 
 
 		 385 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  22.92 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  22.35 
 
 		 383 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2967  hypothetical protein  26.67 
 
 		 350 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  25.25 
 
 		 384 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  23.44 
 
 		 385 aa  43.5  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>