178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3240 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
517 aa  1076    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  41.36 
 
 
506 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  40.16 
 
 
491 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  40.64 
 
 
491 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  40.74 
 
 
492 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  40.52 
 
 
492 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  40.52 
 
 
492 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 
439 aa  294  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  39.09 
 
 
510 aa  291  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  38.14 
 
 
474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  38.14 
 
 
474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  38.14 
 
 
474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  38.14 
 
 
494 aa  281  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  36.25 
 
 
509 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  36.25 
 
 
509 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  36.58 
 
 
509 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  34.5 
 
 
509 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  35.67 
 
 
509 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
797 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  35.08 
 
 
494 aa  243  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  35.87 
 
 
486 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  33.72 
 
 
503 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  32.55 
 
 
504 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  32.29 
 
 
503 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  31.2 
 
 
504 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 
515 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 
477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  30.41 
 
 
498 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  32.69 
 
 
393 aa  60.1  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  30.72 
 
 
392 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  30.5 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  30.07 
 
 
392 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  22.77 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  28.66 
 
 
393 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  22.19 
 
 
379 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11853  probable acetyl-CoA acetyltransferase  30 
 
 
392 aa  53.9  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  22.95 
 
 
379 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  21.82 
 
 
379 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0697  acetyl-CoA acetyltransferases  29.14 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.723631  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  30 
 
 
394 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  29.68 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  21.57 
 
 
379 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  28.03 
 
 
392 aa  51.2  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4612  acetyl-CoA acetyltransferase  29.61 
 
 
392 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000000000297368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  28.47 
 
 
395 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  24.75 
 
 
389 aa  50.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  28.95 
 
 
389 aa  50.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  28.76 
 
 
392 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.14 
 
 
382 aa  50.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  26.67 
 
 
395 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  27.08 
 
 
395 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  23.36 
 
 
380 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  26.97 
 
 
393 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5725  acetyl-CoA acetyltransferase  27.4 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  29.93 
 
 
398 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  26.39 
 
 
393 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3818  acetyl-CoA acetyltransferases  29.41 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120248  normal  0.0579572 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  25 
 
 
383 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  25.49 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  30.87 
 
 
412 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  27.36 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  25.48 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5969  acetyl-CoA acetyltransferases  27.4 
 
 
396 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.661429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  29.93 
 
 
398 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  27.63 
 
 
392 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  26.63 
 
 
392 aa  47.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  30.87 
 
 
405 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  28.19 
 
 
387 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  27.56 
 
 
391 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  32.62 
 
 
392 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1265  acetyl-CoA acetyltransferase  26.79 
 
 
400 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0810323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2591  acetyl-CoA acetyltransferase  29.56 
 
 
401 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  30.63 
 
 
395 aa  47  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  26.09 
 
 
393 aa  47  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  24.84 
 
 
393 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  25.48 
 
 
393 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0252  putative acetyl-CoA acyltransferase  25.49 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.152844  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  25.48 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  21.38 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01744  acetoacetyl-CoA thiolase  26.09 
 
 
391 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.569718  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  28.86 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5347  acetyl-CoA acetyltransferase  26.67 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0980846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  26.35 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  27.7 
 
 
416 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  25.48 
 
 
393 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  25.48 
 
 
393 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  25.48 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  25.48 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  23.33 
 
 
383 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  30.2 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  25.48 
 
 
393 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.43 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  27.45 
 
 
392 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2394  acetyl-CoA acetyltransferase  29.84 
 
 
395 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  29.87 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  25.64 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  27.4 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  29.33 
 
 
395 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  26.92 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  29.68 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>